262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1561 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  100 
 
 
244 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  49.58 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  48.03 
 
 
251 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1657  protein of unknown function DUF45  45.85 
 
 
244 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  43.39 
 
 
243 aa  203  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  38.49 
 
 
241 aa  195  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  37.83 
 
 
238 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  36.1 
 
 
244 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  33.77 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0073  protein of unknown function DUF45  33.09 
 
 
316 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.658711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  33.48 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  30.71 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  29.46 
 
 
240 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.68 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  29.91 
 
 
240 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  29.26 
 
 
252 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  25.66 
 
 
262 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30.57 
 
 
237 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  28.37 
 
 
217 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.61 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  26.53 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.14 
 
 
245 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.77 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  29.85 
 
 
249 aa  92.4  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  25.31 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  27.87 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  29.41 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  31.22 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  30.08 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  29.41 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  27.62 
 
 
239 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  28.23 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  27.27 
 
 
481 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  38.68 
 
 
244 aa  85.9  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  29.47 
 
 
225 aa  86.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.11 
 
 
234 aa  85.9  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  25.88 
 
 
243 aa  85.5  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  38 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  32.14 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  26.15 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  27.01 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  25.64 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  26.61 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  23.74 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  27.49 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  25.5 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  28.64 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  23.61 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  44.58 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  26.34 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  26.63 
 
 
222 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  22.89 
 
 
223 aa  79  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  28.12 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  37.37 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  25.71 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  37.37 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  37.37 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  37.37 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  37.37 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  37.37 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  37.37 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  37.37 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  29.25 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  34.34 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  36.36 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  37.37 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  36.36 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  36.36 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  37.37 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  36.36 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  36.36 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  24.15 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  27.56 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  39.45 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  24.02 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  30.88 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  31.76 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  25.69 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  27.23 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  35.35 
 
 
300 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  35.35 
 
 
300 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  32.38 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  26.29 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  34.34 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  25.98 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  36.11 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  33.61 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  24.76 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  24.55 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  33.04 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  30.53 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  28.37 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  24.63 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  24.26 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  35.09 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  24.06 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  20.67 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>