More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1504 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1313 aa  2696    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  61.19 
 
 		 1101 aa  1307    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  59.27 
 
 		 1063 aa  1226    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  38.88 
 
 		 782 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1238 aa  360  8e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  37.63 
 
 		 985 aa  350  7e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1060 aa  337  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  35.09 
 
 		 1914 aa  296  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.81 
 
 		 991 aa  274  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 1714 aa  273  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.98 
 
 		 1266 aa  266  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 957 aa  225  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 		 1526 aa  222  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  40 
 
 		 828 aa  221  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  27.86 
 
 		 941 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 454 aa  206  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 412 aa  201  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.39 
 
 		 2145 aa  200  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1261 aa  198  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  29.98 
 
 		 1009 aa  186  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1450 aa  182  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 		 1186 aa  181  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 1596 aa  180  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1550 aa  177  8e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.29 
 
 		 725 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  34.3 
 
 		 340 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 		 1424 aa  169  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 408 aa  168  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 343 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.66 
 
 		 771 aa  163  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.15 
 
 		 787 aa  160  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1039 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 		 438 aa  147  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  30.43 
 
 		 825 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 923 aa  142  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.77 
 
 		 1507 aa  141  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1025 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.96 
 
 		 1162 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1404 aa  138  8e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.38 
 
 		 740 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 1162 aa  137  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 924 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 		 885 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 949 aa  132  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  21.83 
 
 		 1328 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.42 
 
 		 852 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  27.25 
 
 		 755 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  27.83 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.54 
 
 		 1021 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.22 
 
 		 609 aa  129  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.11 
 
 		 809 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 911 aa  127  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  22.48 
 
 		 799 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.48 
 
 		 971 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  25.8 
 
 		 836 aa  123  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.98 
 
 		 636 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  28.19 
 
 		 834 aa  123  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  26.74 
 
 		 1147 aa  122  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  27.61 
 
 		 357 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 1215 aa  121  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 649 aa  121  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  18.94 
 
 		 1105 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.2 
 
 		 493 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.86 
 
 		 694 aa  120  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 760 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1508  hypothetical protein  93.44 
 
 		 64 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.213488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 751 aa  119  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.84 
 
 		 568 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 568 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.32 
 
 		 1291 aa  117  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  21.7 
 
 		 991 aa  115  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25.04 
 
 		 1611 aa  115  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  26.04 
 
 		 364 aa  115  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  26.42 
 
 		 708 aa  114  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1285 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.58 
 
 		 1429 aa  112  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  26.32 
 
 		 671 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  25.97 
 
 		 1054 aa  110  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 1020 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  30 
 
 		 490 aa  109  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2620  Tetratricopeptide TPR_4  29.86 
 
 		 303 aa  109  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.866097  normal  0.0216756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.55 
 
 		 767 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  22.28 
 
 		 1044 aa  108  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 444 aa  108  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  32.58 
 
 		 311 aa  107  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.21 
 
 		 1040 aa  107  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.85 
 
 		 667 aa  107  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 659 aa  107  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.5 
 
 		 732 aa  106  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 966 aa  105  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1958 aa  105  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 443 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  25.09 
 
 		 827 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 1048 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.31 
 
 		 999 aa  102  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.28 
 
 		 1295 aa  102  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1676 aa  101  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.95 
 
 		 1360 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  27.21 
 
 		 1013 aa  100  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  23.81 
 
 		 981 aa  100  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>