69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1489 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  61.03 
 
 		 197 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  51.38 
 
 		 219 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  56.25 
 
 		 196 aa  239  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  53.65 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  59.22 
 
 		 196 aa  235  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  53.06 
 
 		 196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.22 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  25.35 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  25.54 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  32.86 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  26.15 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  34.15 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  34.15 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  27.78 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  26.29 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  24.23 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  25.43 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  28.64 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  35.29 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  28.99 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  35.64 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  26.95 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  22.58 
 
 		 192 aa  48.9  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  28.08 
 
 		 195 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  48.5  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  27.32 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  24.87 
 
 		 189 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  22.38 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  29.47 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  26.53 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  26.53 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  26.53 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  28.21 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  26.53 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  26.53 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  22.94 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  27.22 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  53.85 
 
 		 185 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  26.53 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  25.6 
 
 		 198 aa  45.4  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  25.37 
 
 		 215 aa  45.1  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  29.06 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  26.02 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  23.75 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  27.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  27.13 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  25.53 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  23.95 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  26.43 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  26.02 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  19.9 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  26.02 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  24.56 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  22.92 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  26.22 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  23.49 
 
 		 187 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  25.5 
 
 		 315 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  24.41 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  26.36 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  26.49 
 
 		 185 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  26.28 
 
 		 265 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  29.57 
 
 		 210 aa  42  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.28 
 
 		 265 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  27.1 
 
 		 222 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  27.78 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>