133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1469 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  100 
 
 
327 aa  668    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  52.47 
 
 
328 aa  352  7e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  52.47 
 
 
326 aa  351  1e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  42.07 
 
 
336 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  41.38 
 
 
334 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  40.8 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  41.49 
 
 
333 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  40.06 
 
 
319 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  38.3 
 
 
337 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  38.63 
 
 
329 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  39.14 
 
 
332 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  36.65 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  36.65 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  35.84 
 
 
330 aa  212  7e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  34.88 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  37.19 
 
 
210 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  48.06 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  41.72 
 
 
339 aa  129  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  47.69 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  48.44 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  44.36 
 
 
141 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  53.51 
 
 
135 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  44.6 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  38.24 
 
 
354 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  32.49 
 
 
197 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  45.31 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  43.94 
 
 
353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  43.94 
 
 
343 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  41.43 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  42.45 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  36.57 
 
 
192 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  41.73 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  44.09 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  33.53 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  39.87 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  42.86 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  42.31 
 
 
365 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  40.29 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  48.57 
 
 
358 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  40.54 
 
 
350 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  35.96 
 
 
242 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  39.24 
 
 
342 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.21 
 
 
186 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  37.34 
 
 
341 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  33.73 
 
 
341 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  36.91 
 
 
345 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  36.69 
 
 
331 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  35.97 
 
 
366 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  37.4 
 
 
345 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  37.12 
 
 
345 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  39.23 
 
 
352 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  39.37 
 
 
256 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  102  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  44.76 
 
 
342 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  39.69 
 
 
334 aa  101  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  34.78 
 
 
340 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  36.08 
 
 
344 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  39.06 
 
 
281 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  34.76 
 
 
334 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  46.22 
 
 
144 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  38.28 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  37.82 
 
 
126 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  30.29 
 
 
344 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  34.69 
 
 
356 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  32.84 
 
 
335 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  33.56 
 
 
340 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  41.07 
 
 
120 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  35.66 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  38.76 
 
 
352 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  38.1 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  36.22 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  34.45 
 
 
127 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  31.72 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  31.1 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  29.6 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  31.93 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  32.03 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  32.03 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  38.24 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  26.67 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0517  prophage maintenance system killer protein  45.45 
 
 
93 aa  70.5  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  27.73 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  26.89 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  27.73 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  53.57 
 
 
129 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  26.89 
 
 
352 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  42.68 
 
 
108 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  26.89 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1088  hypothetical protein  44.44 
 
 
73 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  25.64 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  38.75 
 
 
81 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  41.25 
 
 
129 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.28 
 
 
131 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  39.29 
 
 
55 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  32.56 
 
 
130 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  31.07 
 
 
132 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  41.54 
 
 
127 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  44 
 
 
126 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  39.68 
 
 
123 aa  52.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>