More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1459 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1459  riboflavin kinase / FAD synthetase  100 
 
 
320 aa  649  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  6.64763e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  59.69 
 
 
320 aa  378  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0372  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  57.63 
 
 
321 aa  364  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  2.76676e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  54.21 
 
 
321 aa  348  8e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  7.35935e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0370  riboflavin biosynthesis protein RibF  52.35 
 
 
321 aa  332  7e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.125476  normal  0.302876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0405  riboflavin biosynthesis protein RibF  53.29 
 
 
321 aa  331  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0771375  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  43.05 
 
 
307 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.7 
 
 
312 aa  246  5e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.71 
 
 
308 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.96 
 
 
309 aa  239  6e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.69 
 
 
310 aa  232  7e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0947  bifunctional protein: riboflavin kinase; FAD synthetase  42.03 
 
 
309 aa  231  8e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.45 
 
 
308 aa  222  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.41 
 
 
311 aa  221  1e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.76 
 
 
310 aa  221  1e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.59125e-05 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.63 
 
 
311 aa  213  4e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0424  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.32 
 
 
330 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.38 
 
 
311 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.66 
 
 
314 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.79 
 
 
322 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4040  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.82 
 
 
322 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.45 
 
 
322 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.86 
 
 
320 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.97835e-07  hitchhiker  1.24783e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.48 
 
 
315 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  38.05 
 
 
306 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.05 
 
 
330 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1416  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.72 
 
 
299 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.29 
 
 
311 aa  202  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2770  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.01 
 
 
317 aa  201  1e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3030  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.04 
 
 
329 aa  199  4e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0492  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.46 
 
 
315 aa  199  4e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.196365 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  35.23 
 
 
312 aa  199  4e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0759  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.06 
 
 
310 aa  199  5e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.776079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4186  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.78 
 
 
322 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0180  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.29 
 
 
329 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.01321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.8 
 
 
325 aa  198  8e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1650  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.62 
 
 
296 aa  198  1e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.16 
 
 
314 aa  197  1e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.3 
 
 
325 aa  198  1e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0201  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.95 
 
 
315 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4863  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.41 
 
 
322 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2051  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.49 
 
 
328 aa  195  8e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0952  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.58 
 
 
316 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.73 
 
 
311 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.0021e-06  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.59 
 
 
314 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.7 
 
 
323 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.07 
 
 
309 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1399  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.84 
 
 
323 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.804257  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.72 
 
 
529 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.1 
 
 
311 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.14 
 
 
320 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.17202e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2118  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  34.6 
 
 
352 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.73 
 
 
309 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0213  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.19 
 
 
322 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.27135e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.21 
 
 
313 aa  193  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0643  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.14 
 
 
322 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4028  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.47 
 
 
338 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
313 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1782  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.39 
 
 
312 aa  192  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0330041  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2724  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.11 
 
 
311 aa  192  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.03356e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.59 
 
 
309 aa  192  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.61 
 
 
311 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  2.37633e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
311 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5201  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.14 
 
 
312 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0957  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.1 
 
 
323 aa  190  3e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0600204 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.57 
 
 
308 aa  190  3e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5826  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.1 
 
 
326 aa  190  3e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3260  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.42 
 
 
356 aa  190  3e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0602  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.78 
 
 
316 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0480  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.53 
 
 
355 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0473  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.29 
 
 
327 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.184681  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0518  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.62 
 
 
327 aa  189  6e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.827373  normal  0.357922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0648  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.43 
 
 
322 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0693294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.98 
 
 
311 aa  188  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.82 
 
 
310 aa  189  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0112657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1124  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.51 
 
 
315 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.59 
 
 
311 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.93 
 
 
311 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0805  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.36 
 
 
308 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00979  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.64 
 
 
311 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60380  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.78 
 
 
312 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.78317e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.84 
 
 
311 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2567  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.58 
 
 
325 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.7 
 
 
314 aa  186  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  36.05 
 
 
309 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1187  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.93 
 
 
309 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1837  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.64 
 
 
311 aa  186  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0709  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.01 
 
 
314 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0861  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.19 
 
 
322 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.204041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4560  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.71 
 
 
316 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.270493  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1061  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.12 
 
 
317 aa  185  1e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.76 
 
 
294 aa  185  1e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  37.85 
 
 
310 aa  185  1e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3660  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.9 
 
 
323 aa  184  2e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00940853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.45 
 
 
316 aa  184  2e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3820  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.9 
 
 
323 aa  184  2e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3946  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.9 
 
 
323 aa  184  2e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3550  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.9 
 
 
323 aa  184  2e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3568  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.9 
 
 
323 aa  184  2e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000147848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1658  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.34 
 
 
319 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>