More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1422 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
400 aa  820    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  79.25 
 
 
394 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  76.56 
 
 
395 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  74.19 
 
 
395 aa  598  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  75.25 
 
 
382 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  77.86 
 
 
401 aa  566  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  71.82 
 
 
395 aa  555  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  47.87 
 
 
385 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  48.49 
 
 
379 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  48.87 
 
 
385 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  50.5 
 
 
389 aa  360  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
388 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
386 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  43.36 
 
 
379 aa  335  9e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  44.5 
 
 
386 aa  315  8e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  45.74 
 
 
380 aa  309  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  41.96 
 
 
375 aa  309  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  41.56 
 
 
386 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  41.6 
 
 
382 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  41.83 
 
 
388 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  42.43 
 
 
379 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  45.86 
 
 
383 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  43.11 
 
 
382 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  42.33 
 
 
375 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
387 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  42 
 
 
375 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
374 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  40.2 
 
 
377 aa  285  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  41.1 
 
 
380 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  41.8 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  41.52 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  41.11 
 
 
361 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  40.35 
 
 
376 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
376 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
376 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
376 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  40.35 
 
 
376 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
376 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
376 aa  282  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  41.5 
 
 
374 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
376 aa  282  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  40.1 
 
 
376 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  40.75 
 
 
379 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  40.75 
 
 
379 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  40.75 
 
 
379 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  40.75 
 
 
379 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  40.75 
 
 
379 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  42.43 
 
 
385 aa  280  3e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  39.15 
 
 
374 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  40.9 
 
 
381 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  41.75 
 
 
375 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  41.44 
 
 
382 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  39.79 
 
 
381 aa  279  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  38.67 
 
 
386 aa  279  7e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  39.2 
 
 
375 aa  278  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
382 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
382 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  39.25 
 
 
378 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  40.15 
 
 
388 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  39.25 
 
 
378 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  39.5 
 
 
373 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  41.04 
 
 
377 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  39.9 
 
 
384 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  38.4 
 
 
375 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
374 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1670  chaperone protein DnaJ  42.36 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal  0.0271561 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  39.5 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0455  chaperone protein DnaJ  40.9 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  39.5 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  41.25 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  39.5 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  39.5 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  37.56 
 
 
376 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  38.61 
 
 
379 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  40.27 
 
 
356 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  39.95 
 
 
382 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  38.25 
 
 
378 aa  272  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  40.8 
 
 
359 aa  272  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  38.39 
 
 
374 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  39.85 
 
 
377 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  40.15 
 
 
379 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  41.4 
 
 
380 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
378 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  40.75 
 
 
376 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  38.65 
 
 
377 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  38.88 
 
 
381 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  40.15 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  38.5 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  39.6 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  39.35 
 
 
375 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  40.75 
 
 
375 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
378 aa  269  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  38.85 
 
 
376 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  39.75 
 
 
377 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  41.43 
 
 
379 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  41.29 
 
 
374 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>