More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1346 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 163 aa  322  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  63.75 
 
 		 169 aa  207  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  63.52 
 
 		 167 aa  199  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  52.47 
 
 		 168 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  54.72 
 
 		 168 aa  177  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  50.62 
 
 		 164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  47.77 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  41.88 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 193 aa  95.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  39.73 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  36.65 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  41.84 
 
 		 182 aa  90.5  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 144 aa  84.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  38.51 
 
 		 159 aa  84  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  33.55 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  35.48 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  32.68 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  33.76 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  36.96 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.6 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  35.54 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  34.56 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.4 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  37.2 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  32.61 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>