More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1174 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  72.66 
 
 		 435 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  78.77 
 
 		 434 aa  706    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  100 
 
 		 431 aa  886    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  74.41 
 
 		 434 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  71.46 
 
 		 434 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  68.71 
 
 		 433 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  67.92 
 
 		 433 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  56.3 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  51.71 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  48.51 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  47.2 
 
 		 409 aa  352  5.9999999999999994e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  45.91 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  48.13 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  53.92 
 
 		 411 aa  336  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  47.24 
 
 		 407 aa  335  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  51.9 
 
 		 426 aa  332  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  48.95 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  47.84 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  48 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  47.71 
 
 		 433 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  47.71 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  47.71 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  47.73 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  45.97 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  46.65 
 
 		 433 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  50.42 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  50.42 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  45.71 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  50.42 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  50.42 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  50.42 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  50.42 
 
 		 387 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  50.14 
 
 		 387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  49.86 
 
 		 392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.28 
 
 		 582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  49.73 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.96 
 
 		 429 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  49.18 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  42.42 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  49.44 
 
 		 414 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.28 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  45.55 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  47.34 
 
 		 414 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  44.17 
 
 		 426 aa  299  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  49.18 
 
 		 396 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45.28 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  43.3 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  48.91 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  44.53 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45.81 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  48.91 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  47.94 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  43.3 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  49.41 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  48.91 
 
 		 396 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  43.37 
 
 		 417 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  44.62 
 
 		 429 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  43.7 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  49.18 
 
 		 404 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  43.93 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  44.88 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  43.2 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  43.93 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  43.93 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  43.2 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  43.93 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  45.41 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  43.2 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  43.32 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  49.58 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  43.96 
 
 		 489 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  43.2 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  43.93 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  39.76 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  43.2 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  43.93 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  43.93 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  43.93 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  44.95 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  43.69 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  43.93 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.13 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  48.07 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  43.69 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  43.7 
 
 		 489 aa  293  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  44.06 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  43.69 
 
 		 428 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  43.7 
 
 		 441 aa  292  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  39.02 
 
 		 419 aa  292  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  47.68 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  41.91 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.31 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.95 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  45.17 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  42.72 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  46.4 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  47.44 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  43.46 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  38.78 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  42.56 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>