More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1135 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  64.43 
 
 
610 aa  841  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  100 
 
 
610 aa  1260  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  66.72 
 
 
610 aa  881  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  65.74 
 
 
609 aa  852  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  70 
 
 
610 aa  907  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  67.38 
 
 
610 aa  875  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  62.79 
 
 
607 aa  817  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  43.24 
 
 
633 aa  522  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  40.46 
 
 
603 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.42642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  39.57 
 
 
603 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.90316e-12 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 
603 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 
633 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  41.07 
 
 
596 aa  417  1e-115  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 
592 aa  418  1e-115  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  38.57 
 
 
592 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 
605 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 
637 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 
612 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  38.25 
 
 
587 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
591 aa  389  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 
597 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 
597 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 
590 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 
597 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 
598 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 
592 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 
598 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 
590 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 
601 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  34.43 
 
 
568 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 
601 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  36.46 
 
 
599 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 
652 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 
601 aa  372  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
601 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
601 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 
594 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 
598 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 
605 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
617 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 
605 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  35.65 
 
 
597 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 
598 aa  365  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
598 aa  359  9e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 
605 aa  357  3e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 
601 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 
597 aa  354  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 
601 aa  355  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
580 aa  355  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
602 aa  355  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 
598 aa  355  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  35.71 
 
 
580 aa  353  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 
607 aa  353  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
601 aa  353  6e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
660 aa  353  6e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 
597 aa  353  7e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 
672 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 
630 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 
604 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
649 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 
601 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 
608 aa  351  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 
604 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 
606 aa  350  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 
604 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
663 aa  349  9e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 
607 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 
599 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 
669 aa  349  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 
604 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 
602 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 
599 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  34.06 
 
 
588 aa  346  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  34.06 
 
 
601 aa  346  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
601 aa  346  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 
597 aa  345  9e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.90287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 
606 aa  346  9e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  34.24 
 
 
602 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 
593 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
616 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 
605 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 
606 aa  344  3e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  3.27223e-05 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.42 
 
 
602 aa  342  8e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.05 
 
 
599 aa  342  9e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
604 aa  342  9e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 
601 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 
685 aa  342  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 
601 aa  341  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 
599 aa  342  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 
606 aa  341  3e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 
600 aa  340  3e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 
606 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.25 
 
 
602 aa  340  6e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
607 aa  340  6e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 
602 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 
602 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
600 aa  340  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 
602 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 
606 aa  338  1e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.57 
 
 
602 aa  337  3e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>