More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1079 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1079  ATPase  100 
 
 
421 aa  861    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  72.92 
 
 
421 aa  617  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  65.62 
 
 
427 aa  550  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  64.27 
 
 
427 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  64.2 
 
 
421 aa  537  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  59.38 
 
 
417 aa  497  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  58.65 
 
 
419 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  39.43 
 
 
418 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.91 
 
 
409 aa  263  4e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  34.63 
 
 
455 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.11 
 
 
405 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  32.78 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  33.25 
 
 
418 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  35.73 
 
 
412 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  30.24 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  31.33 
 
 
416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.34 
 
 
255 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  37.15 
 
 
273 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
273 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
273 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
273 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
273 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
273 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  33.33 
 
 
419 aa  183  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  36.48 
 
 
255 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
273 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
273 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
273 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.62 
 
 
269 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  35.58 
 
 
271 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  34.5 
 
 
414 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  37.9 
 
 
254 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.32 
 
 
255 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
255 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 
255 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.32 
 
 
255 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.09 
 
 
264 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
293 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  35.92 
 
 
266 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
255 aa  177  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  37.1 
 
 
267 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 
268 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  38.43 
 
 
265 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  38.43 
 
 
265 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  37.65 
 
 
278 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.66 
 
 
258 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0128  ABC transporter related  30 
 
 
376 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15406  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  37.55 
 
 
260 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  38.04 
 
 
269 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.02 
 
 
274 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.93 
 
 
268 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  38.25 
 
 
263 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  37.7 
 
 
267 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  38.91 
 
 
284 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
294 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  31.81 
 
 
536 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
265 aa  169  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  38.82 
 
 
262 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  37.45 
 
 
256 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
262 aa  168  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  39.84 
 
 
266 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  38.08 
 
 
274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  36.75 
 
 
273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
270 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
270 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
270 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.83 
 
 
263 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  38.58 
 
 
277 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  41.74 
 
 
270 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
270 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.73 
 
 
266 aa  167  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.3 
 
 
270 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.3 
 
 
270 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  37.45 
 
 
270 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  35.43 
 
 
263 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  34.71 
 
 
267 aa  166  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
257 aa  166  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  38.1 
 
 
258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  37.76 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  38.1 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
256 aa  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30 
 
 
392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.495762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 
270 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.1 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.51 
 
 
625 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  36.94 
 
 
303 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  33.2 
 
 
258 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.68 
 
 
273 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  36.95 
 
 
264 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  37.7 
 
 
267 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  37.9 
 
 
271 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  34.16 
 
 
269 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 
266 aa  163  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  41.05 
 
 
265 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>