More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1059 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  685    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  79.57 
 
 
340 aa  554  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  78.96 
 
 
343 aa  545  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  76.83 
 
 
357 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  73.56 
 
 
341 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  57.01 
 
 
381 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  55.49 
 
 
346 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  55.49 
 
 
342 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  56.4 
 
 
330 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  54.52 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  53.99 
 
 
315 aa  345  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.18 
 
 
344 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3136  NmrA family protein  52.74 
 
 
337 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  43.12 
 
 
391 aa  260  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.94 
 
 
294 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  28.16 
 
 
305 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  29.17 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  28.41 
 
 
297 aa  96.3  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  28.3 
 
 
294 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  28.57 
 
 
292 aa  92.8  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  29.37 
 
 
294 aa  90.1  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
308 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  24.92 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  26.75 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  26.29 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.38 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  27.34 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  27.13 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  26.18 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.5 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  23.49 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.54 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
209 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  29.82 
 
 
209 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.1 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  30.63 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.17 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  29.22 
 
 
221 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  25.1 
 
 
258 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.4 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  25.1 
 
 
332 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  26.67 
 
 
513 aa  63.5  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.71 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.89 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.37 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
218 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  21.46 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 
212 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  26.58 
 
 
267 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  22.62 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.66 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  25.23 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  24.2 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 
219 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  30.34 
 
 
218 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  28.9 
 
 
251 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  21.92 
 
 
320 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  28.9 
 
 
251 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  28.9 
 
 
251 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
251 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  25 
 
 
314 aa  59.3  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
246 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  22.22 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  22.22 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  25.85 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.64 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 
295 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.94 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.01 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  26.14 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  24.2 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  27.09 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  26.43 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  30.29 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.79 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.56 
 
 
320 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
324 aa  57.4  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>