145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1056 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  82.29 
 
 
576 aa  984    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  100 
 
 
576 aa  1199    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  30.66 
 
 
554 aa  205  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.12 
 
 
554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  31.09 
 
 
550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.68 
 
 
592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.14 
 
 
571 aa  196  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  29.27 
 
 
548 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  31.19 
 
 
553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  28.86 
 
 
607 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.89 
 
 
585 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.16 
 
 
583 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.29 
 
 
554 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  28.07 
 
 
567 aa  171  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  28.07 
 
 
567 aa  171  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  28.07 
 
 
567 aa  170  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.76 
 
 
572 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  32.11 
 
 
545 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.82 
 
 
692 aa  166  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  31.56 
 
 
556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.51 
 
 
567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  26.25 
 
 
596 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.25 
 
 
596 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.04 
 
 
578 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.55 
 
 
586 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  26.08 
 
 
596 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  26.61 
 
 
581 aa  150  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.07 
 
 
569 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.54 
 
 
561 aa  139  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.17 
 
 
590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.33 
 
 
595 aa  136  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.24 
 
 
545 aa  133  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  27.87 
 
 
442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.51 
 
 
574 aa  127  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  23.74 
 
 
575 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  23.47 
 
 
508 aa  103  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  25.5 
 
 
558 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  29.23 
 
 
310 aa  94.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  22.71 
 
 
551 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  22.71 
 
 
551 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  24.88 
 
 
597 aa  91.3  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.55 
 
 
747 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  25.83 
 
 
599 aa  87.4  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.55 
 
 
585 aa  87.4  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.89 
 
 
562 aa  87  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.89 
 
 
562 aa  87  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.72 
 
 
610 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.1 
 
 
560 aa  75.1  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  22.32 
 
 
568 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  22.18 
 
 
568 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.43 
 
 
567 aa  73.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.99 
 
 
558 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  23 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  23 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.44 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.18 
 
 
562 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  22.2 
 
 
565 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.14 
 
 
562 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  22.81 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.47 
 
 
563 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.67 
 
 
560 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.3 
 
 
580 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.52 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.32 
 
 
608 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.69 
 
 
548 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  23.77 
 
 
564 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.15 
 
 
554 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  22.14 
 
 
562 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  18.92 
 
 
591 aa  63.9  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.43 
 
 
549 aa  63.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.74 
 
 
580 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  24.29 
 
 
582 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  22.77 
 
 
584 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.2 
 
 
561 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.87 
 
 
597 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.9 
 
 
592 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  18.74 
 
 
591 aa  61.6  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.44 
 
 
546 aa  61.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  18.74 
 
 
591 aa  60.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  22.64 
 
 
586 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  21.69 
 
 
692 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  22.64 
 
 
586 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  21.77 
 
 
578 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  23.27 
 
 
590 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  21.67 
 
 
578 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  21.79 
 
 
590 aa  57  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.94 
 
 
592 aa  57  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  24.12 
 
 
568 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.89 
 
 
553 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  21.54 
 
 
570 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.76 
 
 
582 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  22.25 
 
 
585 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  21.65 
 
 
551 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.09 
 
 
586 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  21.65 
 
 
558 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  21.65 
 
 
554 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  21.65 
 
 
558 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  22.57 
 
 
554 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  22 
 
 
568 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.44 
 
 
585 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>