65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1006 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  69.16 
 
 		 214 aa  316  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  64.49 
 
 		 214 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  60.66 
 
 		 214 aa  281  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.48 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  49.53 
 
 		 218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.54 
 
 		 219 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  49.07 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  52.88 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  50 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  51.01 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  45.33 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  46.4 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  44.59 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  49.74 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  47.34 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.55 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  47.78 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  43.27 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40.09 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  42.99 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  44.61 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.46 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  42.25 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  44.27 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.79 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.32 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.04 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  42.49 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.8 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  39.27 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.71 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  40.4 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  35.2 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.73 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  34.04 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  32.26 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  32.8 
 
 		 196 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.16 
 
 		 544 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  31.34 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  31.34 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.8 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  32.83 
 
 		 553 aa  94.7  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  34.69 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.16 
 
 		 570 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.49 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  29.35 
 
 		 545 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  27.78 
 
 		 594 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.11 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  27.41 
 
 		 558 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  27.8 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.8 
 
 		 580 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.32 
 
 		 598 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.67 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  27.42 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.57 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.75 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  27.34 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.77 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  23.5 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.12 
 
 		 172 aa  48.5  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.08 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  25.56 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  30.49 
 
 		 525 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>