More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0960 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 
287 aa  604  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  73.52 
 
 
334 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  72.47 
 
 
333 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  71.43 
 
 
338 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  69.34 
 
 
284 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.01 
 
 
290 aa  428  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.62 
 
 
334 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.44 
 
 
306 aa  346  3e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.63 
 
 
286 aa  335  5e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.17 
 
 
351 aa  330  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.96 
 
 
289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.84 
 
 
284 aa  318  3.9999999999999996e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.84 
 
 
284 aa  319  3.9999999999999996e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.26 
 
 
289 aa  315  6e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
305 aa  289  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.76 
 
 
305 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.88 
 
 
301 aa  288  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.18 
 
 
301 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.53 
 
 
301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.05 
 
 
301 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.18 
 
 
301 aa  285  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.12 
 
 
301 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.77 
 
 
301 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.12 
 
 
302 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
300 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.42 
 
 
301 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.29 
 
 
301 aa  268  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.48 
 
 
309 aa  267  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.96 
 
 
301 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.27 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  60.24 
 
 
173 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.74 
 
 
322 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  57.42 
 
 
209 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  56.77 
 
 
178 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  52.56 
 
 
197 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  55.13 
 
 
180 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  54.84 
 
 
176 aa  178  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  53.25 
 
 
178 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  47.75 
 
 
201 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
208 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  57.05 
 
 
155 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  51.95 
 
 
186 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
186 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  53.16 
 
 
228 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  50.9 
 
 
236 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  50.33 
 
 
185 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
183 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  51.61 
 
 
179 aa  168  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  49.68 
 
 
178 aa  168  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  51.95 
 
 
184 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  52.83 
 
 
225 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  49.69 
 
 
182 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 
179 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  49.36 
 
 
181 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  50.3 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  62.18 
 
 
159 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  50.96 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  50.98 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  51.5 
 
 
235 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  61.54 
 
 
169 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  50.3 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  49.36 
 
 
184 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 
183 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  48.05 
 
 
182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  49.35 
 
 
180 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  63.39 
 
 
119 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  49.38 
 
 
183 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
176 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  49.68 
 
 
158 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 
119 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  50.97 
 
 
236 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  48.82 
 
 
240 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  50.9 
 
 
233 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  46.79 
 
 
177 aa  161  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 
225 aa  161  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  61.61 
 
 
119 aa  161  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  48.7 
 
 
182 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
158 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  48.08 
 
 
180 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  51.32 
 
 
184 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 
150 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  60.5 
 
 
124 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  51.32 
 
 
178 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 
180 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  61.21 
 
 
121 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  44.5 
 
 
213 aa  159  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  47.37 
 
 
180 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 
242 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  48.75 
 
 
182 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 
181 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  48.39 
 
 
186 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
181 aa  158  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
186 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
186 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  50.64 
 
 
156 aa  158  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  51.01 
 
 
163 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  48.08 
 
 
165 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 
181 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  52.32 
 
 
216 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  47.1 
 
 
182 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>