More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0954 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  71.2 
 
 
930 aa  1399    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
927 aa  1926    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  40.84 
 
 
909 aa  684    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  40.9 
 
 
916 aa  686    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  76.64 
 
 
928 aa  1490    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  39.77 
 
 
938 aa  686    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  68.24 
 
 
932 aa  1354    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  29.49 
 
 
812 aa  255  3e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
817 aa  239  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  28.15 
 
 
856 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  26.63 
 
 
911 aa  206  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  25.85 
 
 
760 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.4 
 
 
760 aa  202  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  25.81 
 
 
979 aa  200  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  25.19 
 
 
981 aa  197  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  26.27 
 
 
969 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 
764 aa  190  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.08 
 
 
981 aa  188  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25.49 
 
 
978 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  24.51 
 
 
961 aa  184  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 
909 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  27.34 
 
 
978 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 
974 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  26.31 
 
 
1065 aa  179  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  27.45 
 
 
974 aa  178  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 
978 aa  177  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1508  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 
1058 aa  177  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000115937 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.73 
 
 
978 aa  174  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 
973 aa  174  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.73 
 
 
978 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 
973 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.81 
 
 
820 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.73 
 
 
973 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 
973 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.58 
 
 
973 aa  170  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.12 
 
 
974 aa  170  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  30.18 
 
 
784 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  22.95 
 
 
958 aa  168  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 
789 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0925  molybdopterin oxidoreductase  25.78 
 
 
1062 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.53 
 
 
953 aa  164  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  28.15 
 
 
1058 aa  163  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  33.01 
 
 
764 aa  162  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  23.09 
 
 
968 aa  161  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  25.32 
 
 
833 aa  160  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.11 
 
 
973 aa  160  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2255  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.81 
 
 
814 aa  160  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  24.19 
 
 
876 aa  160  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  25.83 
 
 
807 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.05 
 
 
935 aa  156  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  33.44 
 
 
739 aa  155  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.76 
 
 
826 aa  154  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  34.43 
 
 
732 aa  153  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  34.08 
 
 
739 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  33.23 
 
 
741 aa  150  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  24.97 
 
 
934 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  22.58 
 
 
814 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.64 
 
 
793 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  22.79 
 
 
814 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  22.79 
 
 
814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  22.79 
 
 
814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  22.79 
 
 
814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  22.79 
 
 
814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  22.79 
 
 
814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  22.79 
 
 
814 aa  149  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  26.39 
 
 
932 aa  148  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.71 
 
 
928 aa  147  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 
738 aa  147  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  32.69 
 
 
807 aa  147  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3394  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.21 
 
 
816 aa  147  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  26.11 
 
 
803 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3261  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.21 
 
 
816 aa  146  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  21.88 
 
 
814 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  21.88 
 
 
814 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  35.16 
 
 
759 aa  146  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  21.88 
 
 
814 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  21.88 
 
 
814 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 
805 aa  145  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0922  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  22.94 
 
 
816 aa  145  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  21.88 
 
 
814 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  34.22 
 
 
720 aa  145  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 
805 aa  144  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  24.83 
 
 
803 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  33.58 
 
 
750 aa  144  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.39 
 
 
794 aa  144  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 
731 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  23.58 
 
 
837 aa  143  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  34.51 
 
 
739 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  24.38 
 
 
839 aa  143  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.22 
 
 
816 aa  142  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  22.08 
 
 
814 aa  142  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  34.88 
 
 
761 aa  142  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  33.97 
 
 
730 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1344  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.23 
 
 
808 aa  140  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  33.94 
 
 
737 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2716  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.11 
 
 
808 aa  140  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.818341  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  25.6 
 
 
1073 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 
800 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  27.98 
 
 
778 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  31.31 
 
 
747 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>