157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0940 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  718    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  69.21 
 
 		 350 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  67.45 
 
 		 349 aa  501  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  69.36 
 
 		 352 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  66.38 
 
 		 349 aa  488  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  63.37 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  64.64 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  58.72 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  58.48 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  54.39 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  52.49 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  51.18 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  52.29 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  50.29 
 
 		 342 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  49.71 
 
 		 334 aa  340  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  48.83 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  47.95 
 
 		 639 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  47.09 
 
 		 353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  45.32 
 
 		 624 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  45.33 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  43.15 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  44.12 
 
 		 640 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  45.29 
 
 		 334 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  40.87 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  42.94 
 
 		 631 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  41.28 
 
 		 348 aa  268  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  41.64 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  42.07 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  38.95 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  37.19 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  39.54 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  39.54 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  38.62 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  38.37 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  37.07 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  35.44 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  39.6 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  37.61 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  34.89 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  34.81 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  34.81 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  34.81 
 
 		 365 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  37.07 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  37.65 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  35.44 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  35.16 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  35.24 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  34.35 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  35.44 
 
 		 368 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  36.19 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.76 
 
 		 358 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  38.33 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  35.71 
 
 		 368 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  37.5 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  34.16 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  38.84 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  37.89 
 
 		 356 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  38.08 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  37.46 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  34.44 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  38.12 
 
 		 355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  36.64 
 
 		 374 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  36.26 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  33.04 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  34.99 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  33.7 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  38.24 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.34 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  34.07 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  36.01 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  34.62 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  34.81 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  33.8 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  34.07 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  34.89 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  33.79 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  36.26 
 
 		 355 aa  216  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 370 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  36.86 
 
 		 350 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  36 
 
 		 332 aa  212  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  36.13 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  34.76 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.54 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  35.16 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  34.09 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.42 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  32.32 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  33.06 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3490  agmatine deiminase  37.25 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  34.88 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  34.88 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  37.64 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  36.92 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>