More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0925 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  60.56 
 
 		 214 aa  264  8e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  58.45 
 
 		 217 aa  255  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  58.65 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  54.98 
 
 		 223 aa  235  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  56.6 
 
 		 219 aa  234  8e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  56.1 
 
 		 219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  44.55 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  46.41 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.76 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  45.29 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  43.98 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  43.52 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.78 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  43.19 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  40.47 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  42.47 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.31 
 
 		 213 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.38 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  40.93 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  40.49 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  40.09 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  38.74 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  40.47 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  38.54 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  39.07 
 
 		 901 aa  158  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  40.09 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  40.18 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  41.98 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  42.25 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  41.9 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  40.93 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  40.74 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  40.57 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  42.72 
 
 		 240 aa  154  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  38.77 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  42.99 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  40.72 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  38.5 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  42.23 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  42.58 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  39.91 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  39.51 
 
 		 209 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.09 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  39.91 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.25 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 705 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  43 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  41.78 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  39.69 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  43 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  39.32 
 
 		 703 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 213 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 213 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 213 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 217 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  44.9 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  36.84 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  39.07 
 
 		 199 aa  148  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  37.26 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  39.53 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.12 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  43.88 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  40.31 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  41.04 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  40.55 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  40.82 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  38.29 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  38.29 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  37.56 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  43.22 
 
 		 199 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  36.89 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  43.08 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  37.85 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  40 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  37.56 
 
 		 686 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  41.18 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  35.98 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>