39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0909 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  191  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  58.06 
 
 
98 aa  124  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  44.09 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  42.55 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  37.63 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.7 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  32.61 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  32.98 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  27.47 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  30.11 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  31.52 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  32.88 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  31.87 
 
 
104 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  31.91 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1406  hypothetical protein  38.46 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00275474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  33.72 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  35.53 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  29.67 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  29.67 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  28.57 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  31.87 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  28.26 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  33.8 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 
108 aa  42.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  31.52 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  28.57 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.41 
 
 
94 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.14 
 
 
102 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0945  plasmid stabilization system protein  22.47 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000281306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.58 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.58 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  31.58 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.21 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.58 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>