More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0856 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  47.59 
 
 		 1044 aa  749    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  44.81 
 
 		 1053 aa  695    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  44.75 
 
 		 1186 aa  683    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  52.09 
 
 		 1183 aa  838    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  53.96 
 
 		 1041 aa  869    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  46.48 
 
 		 960 aa  781    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  100 
 
 		 923 aa  1916    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  54.97 
 
 		 1023 aa  885    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  51.37 
 
 		 1044 aa  799    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  44.61 
 
 		 1201 aa  711    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  52.44 
 
 		 1007 aa  877    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  44.38 
 
 		 1190 aa  645    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  49.94 
 
 		 1049 aa  806    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  42.95 
 
 		 965 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  55.1 
 
 		 1492 aa  927    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  52.25 
 
 		 1581 aa  846    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  44.73 
 
 		 1064 aa  694    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  56.24 
 
 		 1049 aa  947    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1200 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  44.74 
 
 		 775 aa  211  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  26.69 
 
 		 644 aa  205  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.13 
 
 		 908 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.22 
 
 		 997 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  26.93 
 
 		 1148 aa  125  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.39 
 
 		 1067 aa  124  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  26.43 
 
 		 957 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 		 1818 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  41.61 
 
 		 251 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  27.43 
 
 		 818 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  23.32 
 
 		 953 aa  112  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  38.55 
 
 		 253 aa  108  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.99 
 
 		 1091 aa  108  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.1 
 
 		 762 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.1 
 
 		 762 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.66 
 
 		 1086 aa  107  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  25.29 
 
 		 2216 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  35.29 
 
 		 852 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  26.05 
 
 		 1150 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  24.62 
 
 		 766 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  26.36 
 
 		 751 aa  99.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  25.2 
 
 		 1216 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  35.43 
 
 		 273 aa  97.8  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  39.16 
 
 		 263 aa  97.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.53 
 
 		 887 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.89 
 
 		 517 aa  97.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  24.12 
 
 		 1002 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  28.45 
 
 		 781 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  23.91 
 
 		 949 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.38 
 
 		 888 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  29.45 
 
 		 265 aa  95.5  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  26.27 
 
 		 773 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  25.77 
 
 		 799 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  28.28 
 
 		 262 aa  94  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.33 
 
 		 433 aa  92.8  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  28.42 
 
 		 265 aa  92  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.52 
 
 		 614 aa  91.7  6e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  31.38 
 
 		 304 aa  91.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  27.82 
 
 		 444 aa  91.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  37.87 
 
 		 277 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 861 aa  91.3  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  25 
 
 		 801 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 311 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25.4 
 
 		 570 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  28.78 
 
 		 444 aa  90.5  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  32.62 
 
 		 1392 aa  90.9  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  28.78 
 
 		 270 aa  89.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  27.86 
 
 		 437 aa  90.1  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  27.2 
 
 		 303 aa  89.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  89  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.16 
 
 		 1004 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  36.31 
 
 		 586 aa  89  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  24.19 
 
 		 1345 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.1 
 
 		 942 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.07 
 
 		 586 aa  88.6  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.47 
 
 		 725 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  32.97 
 
 		 300 aa  87.8  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1080 aa  87.8  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  31.69 
 
 		 287 aa  87  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  27.95 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.63 
 
 		 798 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 842 aa  85.5  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  27.27 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  24.11 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.69 
 
 		 1237 aa  85.1  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  31.31 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  32.45 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.87 
 
 		 805 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  26.99 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.53 
 
 		 293 aa  84  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  29.46 
 
 		 446 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  23.85 
 
 		 1349 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  24.22 
 
 		 783 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.38 
 
 		 951 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  26.63 
 
 		 447 aa  83.2  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 802 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  32.61 
 
 		 464 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  40.38 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.12 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 		 267 aa  82.8  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 		 570 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>