More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0852 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 289 aa  565  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  84.43 
 
 		 289 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  64.18 
 
 		 288 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  64.54 
 
 		 288 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  64.18 
 
 		 288 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  67.6 
 
 		 288 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  61.89 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  46.9 
 
 		 308 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.97 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  41.32 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  39.51 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  42.52 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  38.65 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.32 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 293 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  35.92 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.98 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 292 aa  168  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.8 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 290 aa  158  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  33.33 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  34.11 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2302  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.418685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0513  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0503611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.31 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  34.93 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.23 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>