65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0843 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  60.82 
 
 
1125 aa  1321    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  56.21 
 
 
1144 aa  1258    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  64.93 
 
 
1133 aa  1430    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  56.21 
 
 
1143 aa  1253    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  63.9 
 
 
1124 aa  1391    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  78.7 
 
 
1121 aa  1789    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  74.04 
 
 
1122 aa  1715    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  42.89 
 
 
1123 aa  820    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  89.95 
 
 
1121 aa  2070    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  84.68 
 
 
1121 aa  1942    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  62.5 
 
 
1140 aa  1378    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  100 
 
 
1125 aa  2304    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  71.42 
 
 
1121 aa  1632    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  74.53 
 
 
1121 aa  1685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  45.04 
 
 
1130 aa  940    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  43.84 
 
 
1166 aa  910    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  30.96 
 
 
1143 aa  462  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  29.39 
 
 
1126 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  29.12 
 
 
1133 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  30.16 
 
 
1137 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  30.12 
 
 
1124 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  28.58 
 
 
1128 aa  351  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  26.69 
 
 
1118 aa  325  4e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  24.46 
 
 
1136 aa  289  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  26.34 
 
 
1120 aa  271  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  52.44 
 
 
352 aa  255  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  25.26 
 
 
1153 aa  247  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  25.07 
 
 
1154 aa  246  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  24.33 
 
 
1120 aa  231  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  24.8 
 
 
1120 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  24.8 
 
 
1120 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.28 
 
 
1126 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  24.65 
 
 
1118 aa  225  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  23.89 
 
 
1121 aa  208  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  25.37 
 
 
1146 aa  203  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  26.33 
 
 
979 aa  187  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  25.32 
 
 
1045 aa  184  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  22.2 
 
 
1151 aa  162  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  23.57 
 
 
1114 aa  158  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  22.59 
 
 
1125 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  23.67 
 
 
1120 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  24.52 
 
 
694 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  28.24 
 
 
462 aa  97.8  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  22.38 
 
 
1093 aa  97.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0895  hypothetical protein  84.78 
 
 
54 aa  86.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  20.25 
 
 
1113 aa  82.8  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  25 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  20.15 
 
 
1109 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  20.87 
 
 
1140 aa  77  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  22.71 
 
 
1181 aa  75.5  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  24.34 
 
 
1107 aa  62.4  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  21.86 
 
 
1207 aa  56.6  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  30.21 
 
 
1159 aa  55.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  24.29 
 
 
1228 aa  53.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  25.1 
 
 
1214 aa  52.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  21.99 
 
 
1141 aa  52  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  25.75 
 
 
1159 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  28.69 
 
 
1138 aa  50.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  25.75 
 
 
1159 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  25.87 
 
 
1159 aa  48.5  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  34.55 
 
 
604 aa  45.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  21.54 
 
 
1145 aa  45.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0773  hypothetical protein  55.88 
 
 
109 aa  45.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4117  SMC domain-containing protein  32.21 
 
 
944 aa  44.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3475  SMC domain protein  32.21 
 
 
944 aa  44.7  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.508672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>