More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0810 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  64.56 
 
 
811 aa  1050    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  61.84 
 
 
760 aa  994    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  61.34 
 
 
760 aa  986    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 
797 aa  1657    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  62.94 
 
 
804 aa  1050    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  64.84 
 
 
802 aa  1070    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  62.89 
 
 
783 aa  1015    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  45.56 
 
 
771 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  52.08 
 
 
860 aa  861    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  63.28 
 
 
776 aa  1031    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  40.2 
 
 
770 aa  543  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  36.29 
 
 
796 aa  442  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  34.81 
 
 
790 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  35.94 
 
 
791 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  34.05 
 
 
793 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  33.84 
 
 
788 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  33.29 
 
 
824 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  34.27 
 
 
796 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  33.59 
 
 
790 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  34.6 
 
 
791 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  32.89 
 
 
825 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  33.04 
 
 
787 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  33.92 
 
 
811 aa  362  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  34.99 
 
 
770 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  33.58 
 
 
824 aa  360  7e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  32.06 
 
 
793 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  32.76 
 
 
780 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  32.23 
 
 
815 aa  355  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  32.02 
 
 
817 aa  355  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  33.21 
 
 
810 aa  354  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  32.42 
 
 
821 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  32.11 
 
 
827 aa  353  8e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  31.98 
 
 
815 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  32.15 
 
 
829 aa  349  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  33.59 
 
 
761 aa  348  2e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  32.04 
 
 
776 aa  347  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  32.91 
 
 
780 aa  346  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  32.88 
 
 
783 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  32.71 
 
 
813 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  31.76 
 
 
765 aa  340  9e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  34.17 
 
 
784 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  34.17 
 
 
784 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  32.6 
 
 
800 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  34.96 
 
 
875 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  30.7 
 
 
899 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  31.95 
 
 
809 aa  337  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  32.37 
 
 
899 aa  331  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  36.19 
 
 
583 aa  316  9e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  32.29 
 
 
787 aa  307  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1018  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 
769 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2790  DEAD/DEAH box helicase-like protein  65.96 
 
 
140 aa  201  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  28.32 
 
 
936 aa  178  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  28.47 
 
 
932 aa  178  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  28.79 
 
 
933 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 
936 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  26.74 
 
 
1005 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  28.95 
 
 
932 aa  174  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  31.48 
 
 
1113 aa  174  5.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.32 
 
 
1082 aa  170  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  27.34 
 
 
753 aa  170  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.31 
 
 
1068 aa  167  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  29.74 
 
 
1137 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  30.28 
 
 
1169 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  30.99 
 
 
1108 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.76 
 
 
1068 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.37 
 
 
1137 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  28.66 
 
 
912 aa  162  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  29.2 
 
 
1138 aa  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  29.23 
 
 
1137 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.66 
 
 
1188 aa  160  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.88 
 
 
1124 aa  160  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.81 
 
 
1080 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.65 
 
 
1169 aa  160  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  27.26 
 
 
893 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  28.12 
 
 
1119 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  28.2 
 
 
1170 aa  158  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  31.1 
 
 
1131 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  29.22 
 
 
1141 aa  157  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  28.6 
 
 
1138 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.3 
 
 
1167 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  29.14 
 
 
1137 aa  154  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  27.75 
 
 
945 aa  154  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  29.71 
 
 
1115 aa  154  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  29.05 
 
 
1137 aa  152  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  28.7 
 
 
1137 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.84 
 
 
1126 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0129  type III restriction protein res subunit  27.69 
 
 
846 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.042937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  29.55 
 
 
1133 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  27.02 
 
 
1125 aa  149  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  28.41 
 
 
1233 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 
1129 aa  146  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.68 
 
 
1174 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  27.7 
 
 
845 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  26.53 
 
 
889 aa  144  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  26.72 
 
 
907 aa  144  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2088  EcoEI R domain protein  35.58 
 
 
546 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340083 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  28.96 
 
 
1130 aa  141  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.25 
 
 
1157 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  28.75 
 
 
1126 aa  136  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3175  type III restriction protein res subunit  26.81 
 
 
1115 aa  132  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>