29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0749 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  358  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  42.44 
 
 
172 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  42.94 
 
 
974 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  39.53 
 
 
172 aa  141  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  29.17 
 
 
172 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
364 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  33 
 
 
281 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  25.57 
 
 
200 aa  54.7  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
178 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
596 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1050  hypothetical protein  31.87 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  25.19 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  25.19 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  26.15 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  24.18 
 
 
222 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  35.06 
 
 
1124 aa  45.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  29.29 
 
 
309 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  31.43 
 
 
213 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  22.07 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  37.7 
 
 
373 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  27.69 
 
 
299 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
282 aa  42  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  27.69 
 
 
299 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
278 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1750  hypothetical protein  24.84 
 
 
204 aa  41.2  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  25.76 
 
 
189 aa  41.2  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  35.09 
 
 
306 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
211 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>