More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0632 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  57.14 
 
 		 201 aa  201  7e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  52.54 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  48.33 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  46.02 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  45.51 
 
 		 191 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.59 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  34.68 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 4079 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.3 
 
 		 594 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1276 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 596 aa  61.2  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  29.77 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 878 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1676 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 512 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 636 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 583 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.72 
 
 		 1385 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.41 
 
 		 397 aa  58.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1094 aa  58.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.71 
 
 		 745 aa  58.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 1069 aa  58.5  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 3035 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 543 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  32.05 
 
 		 837 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.35 
 
 		 916 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 566 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 927 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  26.71 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  29.37 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  25.56 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.12 
 
 		 816 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 649 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 716 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 602 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 836 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 685 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.89 
 
 		 706 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.32 
 
 		 2240 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 758 aa  55.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  23.6 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 699 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.37 
 
 		 936 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.48 
 
 		 560 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  27.42 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 711 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.74 
 
 		 810 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47492  predicted protein  28.05 
 
 		 640 aa  54.7  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00475484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1994  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1400 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 465 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 		 750 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.97 
 
 		 1013 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 581 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.57 
 
 		 1056 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  28.28 
 
 		 1056 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 280 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  28.4 
 
 		 561 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 566 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 827 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.74 
 
 		 1979 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  27.33 
 
 		 704 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 279 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 363 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  31.86 
 
 		 437 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1049 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 		 784 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 4489 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1022 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1976  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1400 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 612 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 376 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.22 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 804 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 562 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1421 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 743 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 		 784 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.97 
 
 		 635 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.43 
 
 		 818 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 329 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 366 aa  52.8  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.14 
 
 		 561 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 523 aa  52.4  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 361 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.23 
 
 		 267 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 567 aa  52  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 329 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>