158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0628 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  44.59 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  41.72 
 
 		 316 aa  242  6e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  41.08 
 
 		 313 aa  238  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  44.53 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  41.35 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  40.55 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  30.87 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  32.06 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  25.9 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  28.32 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  28.07 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  34.16 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 358 aa  95.9  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  24.68 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  29.71 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25 
 
 		 672 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.57 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  29.69 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  29.69 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  25.38 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  25.61 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  29.08 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  27.31 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  27.76 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  26.7 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.08 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  27.31 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  28.96 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  28.96 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26.51 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.25 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  24.47 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  23.14 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  22.64 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  24.14 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.74 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  24.26 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 		 1523 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  24.56 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  26.07 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 1037 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  24.17 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  22.87 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  24.3 
 
 		 447 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  24.3 
 
 		 447 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  27.06 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  24.41 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  23.47 
 
 		 625 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  28.12 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 1523 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  21.11 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  20.73 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 1177 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 1177 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  27.12 
 
 		 215 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  29.81 
 
 		 574 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  32.71 
 
 		 216 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 1312 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  21.9 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 1340 aa  49.7  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  22.65 
 
 		 396 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  25.19 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1124 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 1162 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  22.22 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 996 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.91 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  26.9 
 
 		 613 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  28.16 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3401  methionine biosynthesis protein MetW  31.43 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  26.06 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 513 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  31.43 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.41 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  24.75 
 
 		 354 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 185 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>