More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0627 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  100 
 
 		 470 aa  942    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  64.44 
 
 		 483 aa  558  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  57.42 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  59.81 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  54.1 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  55.08 
 
 		 463 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  48.33 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  30.08 
 
 		 535 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  31.7 
 
 		 1496 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  30.88 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  29.46 
 
 		 455 aa  143  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 433 aa  143  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  24.68 
 
 		 463 aa  143  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  27.96 
 
 		 426 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 419 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 449 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 453 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 427 aa  126  9e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.12 
 
 		 491 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1470 aa  120  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 444 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  26.44 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 454 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 419 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 421 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 449 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  28.75 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  21.68 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  21.03 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 635 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  26.93 
 
 		 447 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.34 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 444 aa  97.1  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 525 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 455 aa  96.7  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.77 
 
 		 576 aa  95.9  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 441 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.98 
 
 		 504 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  25.1 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 731 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  24.65 
 
 		 445 aa  95.1  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  24.71 
 
 		 413 aa  93.2  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0311  outer membrane CHANEL lipoprotein  30.86 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.564157  normal  0.11877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  20.7 
 
 		 488 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2926  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.71 
 
 		 472 aa  91.3  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 438 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.35 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.35 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.35 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.77 
 
 		 484 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.24 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.25 
 
 		 456 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.07 
 
 		 484 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 441 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 482 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.07 
 
 		 484 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.07 
 
 		 484 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.07 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.7 
 
 		 477 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  21.81 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.61 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>