More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0590 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  75.27 
 
 		 755 aa  1159    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  74.89 
 
 		 760 aa  1135    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  73.71 
 
 		 730 aa  1125    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  72.33 
 
 		 752 aa  1101    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 762 aa  1573    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  63.08 
 
 		 774 aa  951    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  64.46 
 
 		 750 aa  935    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  41.06 
 
 		 783 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  42.05 
 
 		 742 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  40.67 
 
 		 801 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  41.42 
 
 		 743 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  41.42 
 
 		 743 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  36.88 
 
 		 762 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  40.63 
 
 		 787 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  37.41 
 
 		 794 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  41.26 
 
 		 743 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 		 768 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  39.46 
 
 		 838 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  37.8 
 
 		 743 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  39.18 
 
 		 740 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.94 
 
 		 834 aa  439  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  37.66 
 
 		 772 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  38.71 
 
 		 854 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  38.58 
 
 		 862 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  39.5 
 
 		 857 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  39.5 
 
 		 857 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  35.04 
 
 		 786 aa  434  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  38.88 
 
 		 857 aa  432  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  38.58 
 
 		 858 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  38.73 
 
 		 870 aa  432  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  38.92 
 
 		 821 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  40.31 
 
 		 732 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  40.31 
 
 		 728 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  38.87 
 
 		 826 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  39.18 
 
 		 888 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  37.39 
 
 		 841 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 		 846 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  37.54 
 
 		 810 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 846 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  37.47 
 
 		 765 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.91 
 
 		 846 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  36.99 
 
 		 785 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  35.41 
 
 		 850 aa  416  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  37.96 
 
 		 907 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  38.44 
 
 		 844 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  38.44 
 
 		 839 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  38.44 
 
 		 928 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  38.44 
 
 		 844 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  38.44 
 
 		 844 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  38.59 
 
 		 787 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  38.44 
 
 		 844 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  38.44 
 
 		 839 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  37.14 
 
 		 759 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.57 
 
 		 767 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 686 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  35.67 
 
 		 850 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  35.95 
 
 		 776 aa  398  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  36.28 
 
 		 795 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 678 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.8 
 
 		 773 aa  391  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  36.72 
 
 		 698 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 		 675 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  34.89 
 
 		 773 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  33.42 
 
 		 786 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  32.91 
 
 		 815 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  36.41 
 
 		 648 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  33.12 
 
 		 818 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  33.71 
 
 		 748 aa  356  8.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 		 793 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.73 
 
 		 751 aa  354  4e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.93 
 
 		 661 aa  354  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.44 
 
 		 648 aa  354  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  34.83 
 
 		 799 aa  352  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 		 804 aa  352  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  34.15 
 
 		 797 aa  350  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  34.69 
 
 		 824 aa  348  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  33.57 
 
 		 797 aa  348  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.93 
 
 		 765 aa  346  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.48 
 
 		 646 aa  347  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  34.52 
 
 		 779 aa  346  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  32.86 
 
 		 777 aa  345  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 794 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.1 
 
 		 806 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  31.98 
 
 		 805 aa  344  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.83 
 
 		 761 aa  342  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  32.61 
 
 		 796 aa  342  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  32.9 
 
 		 823 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 808 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  32.69 
 
 		 823 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  32.39 
 
 		 803 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  32.2 
 
 		 804 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  31.47 
 
 		 805 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  31.47 
 
 		 833 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  34.59 
 
 		 727 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  32.38 
 
 		 803 aa  337  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  33.52 
 
 		 792 aa  337  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 713 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.06 
 
 		 776 aa  336  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 713 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 713 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>