108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0562 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 332 aa  681    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  54.08 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  52.66 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  46.25 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  47.24 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  40.36 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  40.56 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1298  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  42.65 
 
 		 585 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 554 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1115 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 604 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 682 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1431  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  38.19 
 
 		 806 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.333003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 434 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  58.76 
 
 		 115 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 705 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 641 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  54.74 
 
 		 112 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 575 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 602 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.82 
 
 		 777 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.765489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  46.46 
 
 		 113 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0328  putative PAS/PAC sensor protein  33.19 
 
 		 365 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  37.74 
 
 		 439 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1839  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.31 
 
 		 763 aa  92.8  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.338108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2163  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  41.59 
 
 		 575 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2550  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.71 
 
 		 412 aa  90.5  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665651  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  44.79 
 
 		 119 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3468  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.44 
 
 		 745 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0436703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3012  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.96 
 
 		 619 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  29.09 
 
 		 1251 aa  80.1  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  42.27 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  35.29 
 
 		 104 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 773 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2194  histidine kinase  34.86 
 
 		 609 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 1341 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0472  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.9 
 
 		 853 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000400428 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.9 
 
 		 853 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2973  hypothetical protein  38.98 
 
 		 137 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1117  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  28.12 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  37.36 
 
 		 138 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 117 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 673 aa  62.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.59 
 
 		 834 aa  62.8  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 785 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0369  putative PAS/PAC sensor protein  28.39 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.406027  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  31 
 
 		 1092 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 		 126 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 103 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  38.27 
 
 		 98 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2491  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1715  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.08 
 
 		 749 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  37.21 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  37.21 
 
 		 147 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 94 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 99 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2484  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  40 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.399715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  37.21 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 		 703 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 		 1418 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 111 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 95 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0803  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  37.18 
 
 		 98 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  32.61 
 
 		 100 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  33.7 
 
 		 126 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 99 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  33.72 
 
 		 103 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  34 
 
 		 112 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 120 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  34.78 
 
 		 101 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  37.93 
 
 		 127 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  34.48 
 
 		 120 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  33.7 
 
 		 101 aa  50.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  49.7  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 98 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 469 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0277954  normal  0.755166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 964 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  31.4 
 
 		 106 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  32.97 
 
 		 126 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 104 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 		 1611 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 105 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 97 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  29.07 
 
 		 106 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 832 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 1425 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  34.72 
 
 		 102 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  24.5 
 
 		 1683 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1578 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  25.25 
 
 		 1258 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 101 aa  46.2  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  35 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>