89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0551 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.12 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  37.09 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  34.55 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  36.36 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.67 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.81 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.77 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.71 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  44 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  49.18 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  47.69 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  48.33 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  26.19 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.58 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.74 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.45 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.26 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.52 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  27.89 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  27.03 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.49 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.86 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  23.08 
 
 		 133 aa  51.2  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.12 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.77 
 
 		 139 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.99 
 
 		 136 aa  48.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.95 
 
 		 135 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 		 122 aa  47.8  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0185  ferric siderophore transport system,innermembrane protein E  30.84 
 
 		 131 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.224438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.18 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  24.34 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.12 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.08 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.97 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.1 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0439  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.69 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.29268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.58 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.44 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.95 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.08 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.64 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4166  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.03 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.03 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.03 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  23.74 
 
 		 135 aa  44.7  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2278  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.74 
 
 		 141 aa  44.7  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0502314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.18 
 
 		 140 aa  44.7  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.46 
 
 		 135 aa  44.3  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  25.76 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.66 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.15 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  27.54 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  23.74 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2764  hypothetical protein  24.22 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  24.64 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  21.01 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  21.43 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  31.67 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.86 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  31.25 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 		 130 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  23.44 
 
 		 136 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.32 
 
 		 132 aa  42.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 		 134 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.33 
 
 		 217 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.3 
 
 		 135 aa  41.6  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.95 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.65 
 
 		 141 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  36.11 
 
 		 135 aa  41.2  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1568  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.38 
 
 		 127 aa  41.2  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.969872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.86 
 
 		 135 aa  40.8  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.3 
 
 		 134 aa  40.8  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  31.25 
 
 		 134 aa  40.8  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1698  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.59 
 
 		 250 aa  40.8  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>