126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0550 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  46.89 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  46.89 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  44.63 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.32 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  44.63 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  43.75 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.1 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.13 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  28.78 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.07 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.14 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  34.82 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  36.84 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  38.36 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.8 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.53 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.08 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.28 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.11 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  31.43 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  23.27 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  29.63 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  24.42 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.64 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.8 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.36 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.49 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 134 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  22.41 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  25.83 
 
 		 135 aa  48.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 134 aa  47.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.65 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  23.08 
 
 		 135 aa  47.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  31.16 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  35.38 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.55 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  23.56 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  21.84 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.35 
 
 		 122 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.08 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.43 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  21.84 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3761  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.56 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.64 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  21.84 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  22.75 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.16 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.07 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.11 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.64 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  26.61 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 140 aa  44.7  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.53 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4167  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.64 
 
 		 134 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0632  biopolymer transport protein ExbD, putative  32.14 
 
 		 139 aa  44.3  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.362389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  23.42 
 
 		 134 aa  44.3  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.51 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.55 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.47 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.07 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  26.23 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2484  putative TonB system transport protein ExbD2  29.17 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000778685  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1852  biopolymer transport exbD protein  24.32 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.34 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  23.56 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  24.1 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.91 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  23.56 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  25 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  20.48 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  24.1 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.39 
 
 		 136 aa  42  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  24.1 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  24.1 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  24.1 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  24.1 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  25.37 
 
 		 134 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>