More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0424 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  100 
 
 		 407 aa  794    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  62.07 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  53.92 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  55.61 
 
 		 410 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  53.11 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  52.7 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  48.86 
 
 		 401 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  50.37 
 
 		 401 aa  355  5.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  44.44 
 
 		 424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 418 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 427 aa  305  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  43.46 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 416 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 		 440 aa  273  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 499 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 421 aa  270  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 403 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  42.05 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 410 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 420 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 451 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 420 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  41.71 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  38.94 
 
 		 415 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 413 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 406 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 422 aa  253  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  42.06 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 416 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  41.64 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 416 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  39.14 
 
 		 412 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  38.02 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  38.52 
 
 		 433 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  39.73 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 457 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 414 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 427 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  38.62 
 
 		 419 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 479 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 432 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 432 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  38.3 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  39.8 
 
 		 416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  39.58 
 
 		 424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  36.9 
 
 		 454 aa  223  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  39.66 
 
 		 415 aa  223  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  36.84 
 
 		 408 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  36.77 
 
 		 410 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  36.29 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  39.43 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 415 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 524 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 422 aa  130  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 447 aa  123  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  29.65 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  29.35 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  26.12 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>