More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0407 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0407  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 162 aa  336  7e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2040  protein tyrosine phosphatase  48.1 
 
 		 189 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000170102  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0391  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1853  protein tyrosine phosphatase  48.97 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2051  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000114311  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  34.19 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  37.82 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.82 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.9 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  34.19 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  36.25 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.26 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  34.19 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  34.87 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  37.42 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  36.49 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  31.17 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  36.54 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  35.8 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  35.95 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  35.03 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  35.76 
 
 		 201 aa  98.6  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  34.64 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  36.36 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  35.1 
 
 		 201 aa  97.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  36.24 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.08 
 
 		 453 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  38.16 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  36.77 
 
 		 172 aa  97.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  34.84 
 
 		 156 aa  97.1  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  36.42 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  32.05 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  31.37 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  36.6 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  35.53 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  32.47 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  33.54 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  32.47 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  32.91 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.99 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  32.93 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.41 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.53 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.64 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  37.33 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  34.9 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  31.17 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.17 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  34.42 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  34.9 
 
 		 171 aa  91.3  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.06 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>