123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0399 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0399  redox-active disulfide protein 2  100 
 
 
98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11443  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1475  redox-active disulfide protein 2  72.73 
 
 
99 aa  144  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337383  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2025  redox-active disulfide protein 2  74.03 
 
 
78 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1705  redox-active disulfide protein 2  60.2 
 
 
94 aa  117  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0462  redox-active disulfide protein 2  68.83 
 
 
78 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000236165  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0508  redox-active disulfide protein 2  59.21 
 
 
77 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1116  redox-active disulfide protein 2  56.58 
 
 
77 aa  98.6  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1708  redox-active disulfide protein 2  50.65 
 
 
79 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0702  redox-active disulfide protein 2  54.67 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.94898 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0943  redox-active disulfide protein 2  53.33 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3191  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  46.05 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3619  redox-active disulfide protein 2  47.37 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1221  redox-active disulfide protein 2  55.41 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2554  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 
80 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000309431  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2641  redox-active disulfide protein 2  48.05 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1007  redox-active disulfide protein 2  45.45 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00309602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0856  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 
75 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_878  redox-active disulfide protein 2  44.87 
 
 
80 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.895707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1067  redox-active disulfide protein 2  53.42 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1856  redox-active disulfide protein 2  44.87 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1877  redox-active disulfide protein 2  52 
 
 
76 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0894  redox-active disulfide protein 2  43.59 
 
 
80 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1726  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  50 
 
 
76 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0586  redox-active disulfide protein 2  49.32 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1211  redox-active disulfide protein 2  51.28 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1624  redox-active disulfide protein 2  44.87 
 
 
81 aa  77  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000124454  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0535  redox-active disulfide protein 2  42.11 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3496  redox-active disulfide protein 2  42.11 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2350  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 
80 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.4313  hitchhiker  0.00041608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3835  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 
80 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3775  redox-active disulfide protein 2  42.11 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0536  redox-active disulfide protein 2  42.11 
 
 
78 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2564  redox-active disulfide protein 2  47.3 
 
 
75 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000509192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0588  redox-active disulfide protein 2  48.68 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1749  redox-active disulfide protein 2  49.33 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0327584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0730  redox-active disulfide protein 2  50.68 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000429418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3674  redox-active disulfide protein 2  48.68 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.766727  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4013  redox-active disulfide protein 2  47.37 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0546  redox-active disulfide protein 2  44.59 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2956  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0155  hypothetical protein  44.59 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1028  redox-active disulfide protein 2  51.35 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4282  redox-active disulfide protein 2  50.68 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2180  redox-active disulfide protein 2  54.29 
 
 
75 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000368742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4061  redox-active disulfide protein 2  44.74 
 
 
77 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  0.892222 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0827  redox-active disulfide protein 2  48.68 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000837608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3831  redox-active disulfide protein 2  40.79 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3957  redox-active disulfide protein 2  40.79 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1324  redox-active disulfide protein 2  47.44 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1803  redox-active disulfide protein 2  48 
 
 
80 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1300  redox-active disulfide protein 2  47.3 
 
 
75 aa  73.6  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4599  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  43.59 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1869  hypothetical protein  41.56 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5315  redox-active disulfide protein 2  45.21 
 
 
78 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31849  normal  0.0964369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1090  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 
77 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2948  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  44.74 
 
 
79 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.960362  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3598  redox-active disulfide protein 2  44.59 
 
 
77 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.420898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1829  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  42.11 
 
 
78 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813005  normal  0.88262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0487  redox-active disulfide protein 2  41.33 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1811  redox-active disulfide protein 2  44.74 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3356  redox-active disulfide protein 2  42.11 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1710  hypothetical protein  38.67 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0068017  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0493  redox-active disulfide protein 2  40.79 
 
 
78 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0518  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3660  redox-active disulfide protein 2  45.95 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2047  redox-active disulfide protein 2  44.3 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1903  redox-active disulfide protein 2  45.95 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.76321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0176  redox-active disulfide protein 2  38.67 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1907  redox-active disulfide protein 2  38.46 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0881518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0436  redox-active disulfide protein 2  48 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20080  redox-active disulfide protein 2  39.47 
 
 
77 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1322  redox-active disulfide protein 2  46.15 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1620  redox-active disulfide protein 2  39.47 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2567  redox-active disulfide protein 2  46.75 
 
 
80 aa  70.1  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0264  redox-active disulfide protein 2  44.44 
 
 
73 aa  69.3  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3648  redox-active disulfide protein 2  48.65 
 
 
77 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1184  redox-active disulfide protein 2  45.95 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2843  glutaredoxin  38.96 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.486982  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1222  redox-active disulfide protein 2  42.11 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3420  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  39.74 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1429  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  40.79 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0018  redox-active disulfide protein 2  45.95 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3943  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.26 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2073  redox-active disulfide protein 2  44.87 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4203  putative glutaredoxin family protein/Thio-disulfide isomerase  41.1 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3416  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  38.46 
 
 
78 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369553  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3817  redox-active disulfide protein 2  39.47 
 
 
78 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3642  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  38.67 
 
 
78 aa  67  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0691  redox-active disulfide protein 2  45.95 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.322744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0185  putative thioredoxin  43.42 
 
 
77 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1934  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  41.03 
 
 
78 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1484  redox-active disulfide protein 2  42.47 
 
 
80 aa  67  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.591966  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0752  redox-active disulfide protein 2  36.84 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0149  redox-active disulfide protein 2  42.47 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0111  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  40.26 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0815  hypothetical protein  36.36 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.817572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2878  redox-active disulfide protein 2  50 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2332  redox-active disulfide protein 2  38.16 
 
 
78 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.650672  normal  0.0752191 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1093  hypothetical protein  39.73 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000000590144  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0336  hypothetical protein  38.57 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>