18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0393 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0393  hydroxyneurosporene synthase CrtC  100 
 
 		 373 aa  780    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0465  hydroxyneurosporene synthase  51.62 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0428  hydroxyneurosporene synthase  50.68 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000692548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0360  hydroxyneurosporene synthase  50.68 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0314991  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1720  hydroxyneurosporene synthase CrtC  50.13 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000497436  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1781  hydroxyneurosporene synthase  47.43 
 
 		 376 aa  362  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0186399 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1988  hydroxyneurosporene synthase  46.77 
 
 		 376 aa  358  8e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0180674  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1288  hydroxyneurosporene synthase  24.49 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6442  hydroxyneurosporene synthase  24.62 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1357  hypothetical protein  21.41 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000287593  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1705  hydroxyneurosporene synthase  23.98 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3692  hydroxyneurosporene synthase  22.87 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3761  hydroxyneurosporene synthase  24.32 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2725  hydroxyneurosporene synthase  24.06 
 
 		 300 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1615  hydroxyneurosporene synthase  26.43 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25950  Protein of unknown function (DUF2006)  25.37 
 
 		 507 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.311446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2047  hydroxyneurosporene synthase  25.35 
 
 		 283 aa  42.7  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.329916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4006  hydroxyneurosporene synthase  22.62 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>