More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0302 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  730    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  59.61 
 
 		 359 aa  451  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  54.44 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  45.81 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  47.21 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  45.43 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  40.67 
 
 		 387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  31.48 
 
 		 361 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  30.03 
 
 		 359 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  26.84 
 
 		 360 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  29.44 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  26.61 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  26.27 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  27.76 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  28.93 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  26.39 
 
 		 367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  28.05 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  26.76 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  26.05 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.78 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.58 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  28.29 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 		 358 aa  113  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.69 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 792 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.59 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.04 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  26.48 
 
 		 360 aa  92.8  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  25.68 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  22.11 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  23.64 
 
 		 357 aa  90.5  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  25.59 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  22.8 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  24.22 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  23.84 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.16 
 
 		 392 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 391 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  22.68 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  20.77 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.42 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.79 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  25.42 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  20.29 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  25.42 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.25 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  22.52 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  21.23 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  23.29 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.71 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  20.26 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  20.26 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  22.35 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  25.41 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  21.73 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  21.66 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  22.35 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.37 
 
 		 1111 aa  77.4  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 1061 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  21.01 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.84 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  20.7 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  20 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  23.22 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 1040 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 1061 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.13 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  21.27 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  20.18 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  22.05 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1587  tRNA-I(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.35 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  21.58 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  25.76 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  21.29 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  22.77 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>