133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0257 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0257  ATPase  100 
 
 		 403 aa  832    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  61.94 
 
 		 406 aa  531  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  29.18 
 
 		 422 aa  166  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  31.56 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  30.56 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  32.65 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  28.98 
 
 		 439 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  32.56 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  30.23 
 
 		 454 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  31 
 
 		 410 aa  146  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  30.96 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  29.81 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  31.23 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  29.15 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  29.01 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  28.65 
 
 		 437 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  29.18 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  27.09 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  27.29 
 
 		 421 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  27.73 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  26.53 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  27.98 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  46.81 
 
 		 203 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  42.31 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  25.66 
 
 		 445 aa  90.9  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  43.68 
 
 		 769 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  24.93 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  24.25 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  32.09 
 
 		 577 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  36.63 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  37.11 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  29.75 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  34.19 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 709 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  23.82 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  23.63 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  32.63 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.86 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  21.52 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  25.28 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  30.94 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  27.08 
 
 		 532 aa  53.5  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  32.53 
 
 		 352 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.08 
 
 		 647 aa  51.6  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.84 
 
 		 353 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  30.43 
 
 		 670 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  38.46 
 
 		 1125 aa  49.7  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  33.33 
 
 		 582 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  38.33 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  36 
 
 		 1076 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  32.61 
 
 		 657 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  28.99 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  39.22 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  22.05 
 
 		 596 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  31.76 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  31.07 
 
 		 712 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  29.93 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  40.43 
 
 		 864 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  31.4 
 
 		 582 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 		 265 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  46.94 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  39.29 
 
 		 1060 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  37.1 
 
 		 458 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.04 
 
 		 496 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  44.68 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  22.31 
 
 		 697 aa  46.6  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  47.73 
 
 		 382 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  25.41 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  39.66 
 
 		 595 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  46.94 
 
 		 1175 aa  46.6  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  40 
 
 		 650 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.84 
 
 		 1177 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  38.6 
 
 		 581 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  31.34 
 
 		 1189 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  40.82 
 
 		 993 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  39.39 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  35.94 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  40.82 
 
 		 993 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  26.41 
 
 		 857 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  28.57 
 
 		 666 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  31 
 
 		 608 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  42.22 
 
 		 702 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.56 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  32.1 
 
 		 610 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.1 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  40.82 
 
 		 993 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  32.08 
 
 		 176 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.58 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1824  DNA repair ATPase  42 
 
 		 495 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  43.18 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  46.51 
 
 		 926 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.35 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000176519  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  29.76 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  39.53 
 
 		 807 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  37.7 
 
 		 1063 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 700 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  40.38 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3310  SMC domain protein  29.75 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>