More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0251 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0251  ATPase  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  84.02 
 
 		 244 aa  417  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  80.33 
 
 		 244 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  77.87 
 
 		 244 aa  400  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  78.69 
 
 		 244 aa  394  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  78.69 
 
 		 244 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  76.64 
 
 		 244 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  67.78 
 
 		 243 aa  344  7e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  67.92 
 
 		 249 aa  342  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  67.36 
 
 		 254 aa  338  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  67.08 
 
 		 243 aa  333  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  67.5 
 
 		 243 aa  332  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  64.58 
 
 		 245 aa  328  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 		 246 aa  317  7e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  64.66 
 
 		 247 aa  311  5.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  61.92 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  62.08 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  61.25 
 
 		 241 aa  305  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  62.5 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  60.83 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  60 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  61.25 
 
 		 310 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  61.8 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  61.51 
 
 		 283 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 336 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  57.26 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  60.76 
 
 		 332 aa  299  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  59.17 
 
 		 316 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  60.34 
 
 		 333 aa  298  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  62.45 
 
 		 244 aa  296  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  58.75 
 
 		 317 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  60.67 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  59.49 
 
 		 317 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  59.49 
 
 		 314 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  58.23 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  56.54 
 
 		 249 aa  295  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  56.49 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  57.56 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  58.75 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  56.67 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  56.4 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  58.16 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  59.49 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  59.07 
 
 		 261 aa  292  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  57.61 
 
 		 263 aa  292  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  58.65 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  57.81 
 
 		 247 aa  291  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  58.65 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  59.43 
 
 		 255 aa  289  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  56.96 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  54.77 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  58.51 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  60.57 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  55.7 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  60.16 
 
 		 260 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.81 
 
 		 268 aa  288  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  59.41 
 
 		 289 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  59 
 
 		 247 aa  288  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  60.16 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  56.1 
 
 		 262 aa  288  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  56.07 
 
 		 240 aa  287  9e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.08 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  59 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  59 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  54.85 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  55.06 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  56.71 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  57.89 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  58.54 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  55.51 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  59.24 
 
 		 311 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  57.33 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  57.92 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  58.4 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  59.59 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  56.43 
 
 		 279 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  59.59 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  59.59 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  58.23 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  59.09 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 258 aa  284  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 258 aa  284  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 258 aa  284  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 258 aa  284  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 258 aa  284  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 258 aa  284  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 258 aa  284  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  58.23 
 
 		 258 aa  284  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  60.25 
 
 		 282 aa  284  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  56.25 
 
 		 267 aa  284  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>