More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0185 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  63.19 
 
 		 490 aa  647    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.3 
 
 		 493 aa  656    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.71 
 
 		 493 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  75.2 
 
 		 492 aa  778    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 491 aa  1023    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.5 
 
 		 493 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  77.6 
 
 		 491 aa  803    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  73.12 
 
 		 491 aa  787    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  73.93 
 
 		 491 aa  776    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.78 
 
 		 494 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  76.37 
 
 		 491 aa  811    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  79.63 
 
 		 491 aa  829    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.3 
 
 		 495 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.64 
 
 		 461 aa  622  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.65 
 
 		 489 aa  610  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  59.96 
 
 		 494 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  59.36 
 
 		 493 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.48 
 
 		 495 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.81 
 
 		 494 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0947  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.51 
 
 		 505 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.27 
 
 		 495 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.07 
 
 		 495 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.45 
 
 		 506 aa  583  1.0000000000000001e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  56.34 
 
 		 496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  54.07 
 
 		 2135 aa  537  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  52.42 
 
 		 2126 aa  529  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  51.61 
 
 		 580 aa  529  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  51.41 
 
 		 2126 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  51.16 
 
 		 481 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  51.21 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  51.37 
 
 		 481 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  51.39 
 
 		 500 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  50.95 
 
 		 481 aa  495  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  52.69 
 
 		 494 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.21 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.36 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.89 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.72 
 
 		 487 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.9 
 
 		 492 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  49.6 
 
 		 484 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  50.5 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  50.1 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.7 
 
 		 492 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.82 
 
 		 485 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  49.19 
 
 		 489 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.95 
 
 		 482 aa  474  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  49.4 
 
 		 502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.7 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  47.98 
 
 		 480 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.49 
 
 		 489 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.8 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.61 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.8 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  47.05 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  47.85 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  48.25 
 
 		 487 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  47.48 
 
 		 490 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0507  glutamate synthase subunit beta  47.95 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  47.2 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  50.2 
 
 		 488 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  47.78 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0494  glutamate synthase subunit beta  47.95 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0118721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  46.95 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.3 
 
 		 484 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  48.12 
 
 		 484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  46.52 
 
 		 488 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.1 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  47.38 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  47.09 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  48.41 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  48.9 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  48.8 
 
 		 486 aa  448  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  47.73 
 
 		 487 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  50.1 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  47.15 
 
 		 488 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  46.94 
 
 		 487 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  47.14 
 
 		 487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  47.41 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  50.8 
 
 		 489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.09 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  47.64 
 
 		 488 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  47.44 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.98 
 
 		 482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  49.5 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  50.8 
 
 		 489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  50.4 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  46.09 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  50.3 
 
 		 492 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  46.94 
 
 		 487 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.03 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  48.23 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  46.95 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  46.95 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  47.07 
 
 		 491 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  46.67 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  48.99 
 
 		 485 aa  445  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.8 
 
 		 486 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  46.09 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  47.69 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  49.4 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>