More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0178 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  100 
 
 
321 aa  671  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  47.23 
 
 
274 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  42.86 
 
 
223 aa  193  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  48.13 
 
 
247 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  49.73 
 
 
248 aa  186  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  44.97 
 
 
308 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  40.21 
 
 
323 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  37.13 
 
 
286 aa  138  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  49.24 
 
 
293 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  47.14 
 
 
305 aa  129  5e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  6.81555e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.88 
 
 
321 aa  129  7e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  51.97 
 
 
323 aa  127  2e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  45 
 
 
265 aa  128  2e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  44.76 
 
 
305 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  39.62 
 
 
325 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.57 
 
 
301 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  36.04 
 
 
299 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  43.36 
 
 
305 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  43.36 
 
 
305 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  43.36 
 
 
305 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  43.9 
 
 
527 aa  122  1e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  32.9 
 
 
317 aa  120  2e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  40.7 
 
 
296 aa  121  2e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  45.53 
 
 
524 aa  120  2e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  41.62 
 
 
313 aa  121  2e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  42.36 
 
 
303 aa  119  5e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  42.34 
 
 
282 aa  119  5e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  44.12 
 
 
324 aa  119  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  47.11 
 
 
375 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  41.14 
 
 
314 aa  117  2e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  33.33 
 
 
302 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  41.48 
 
 
334 aa  117  4e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.21975e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  38.64 
 
 
317 aa  116  4e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  38.89 
 
 
377 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  38.36 
 
 
325 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  44 
 
 
249 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.48266e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  48.36 
 
 
278 aa  115  1e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  43.33 
 
 
271 aa  115  1e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.31 
 
 
375 aa  115  1e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.52343e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  40 
 
 
304 aa  115  1e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  46.72 
 
 
274 aa  114  2e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.10987e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  36.84 
 
 
316 aa  113  4e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.46497e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  45.31 
 
 
315 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  41.91 
 
 
337 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  40.49 
 
 
313 aa  112  7e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  47.22 
 
 
373 aa  112  7e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  44.22 
 
 
268 aa  112  8e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  30.18 
 
 
319 aa  112  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  2.25062e-06 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  45.45 
 
 
377 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  47.86 
 
 
374 aa  111  1e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  46.28 
 
 
457 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.67 
 
 
372 aa  112  1e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  46.28 
 
 
457 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  46.09 
 
 
425 aa  112  1e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  46.09 
 
 
421 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  46.09 
 
 
425 aa  111  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  45.97 
 
 
238 aa  111  2e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  46.09 
 
 
421 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  45.31 
 
 
446 aa  111  2e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  46.09 
 
 
420 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  50 
 
 
376 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.73675e-08  hitchhiker  4.27958e-09 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  40.83 
 
 
404 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  46.09 
 
 
400 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  50.86 
 
 
271 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.88 
 
 
301 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  37.18 
 
 
300 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  44 
 
 
340 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  43.61 
 
 
233 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  46.28 
 
 
345 aa  110  4e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  8.71581e-05  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  45.45 
 
 
299 aa  110  4e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.48053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  39.77 
 
 
300 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  38.12 
 
 
400 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  50.86 
 
 
271 aa  109  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  39.88 
 
 
450 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  1.16683e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.52 
 
 
442 aa  109  7e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  46.09 
 
 
412 aa  109  7e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  44.72 
 
 
299 aa  109  8e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  43.7 
 
 
324 aa  108  9e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  36.84 
 
 
379 aa  108  9e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  44.72 
 
 
299 aa  108  9e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.66225e-06  hitchhiker  2.31142e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  44.72 
 
 
299 aa  108  9e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.11959e-05  unclonable  2.62337e-05 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  46.09 
 
 
362 aa  108  9e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  44.72 
 
 
299 aa  108  9e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.53251e-07  hitchhiker  4.53788e-08 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  40.43 
 
 
296 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  43.17 
 
 
229 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  43.2 
 
 
533 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  44.17 
 
 
374 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.67566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  38.2 
 
 
317 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.59 
 
 
375 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.19165e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  50.45 
 
 
464 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  44.35 
 
 
454 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  45.45 
 
 
457 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.52586e-09  decreased coverage  1.00746e-08 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  42.98 
 
 
292 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  31.98 
 
 
298 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  41.73 
 
 
262 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  34.04 
 
 
309 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  39.18 
 
 
300 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  44.54 
 
 
299 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  8.73252e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  40.38 
 
 
656 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  49.57 
 
 
507 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>