More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0174 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 257 aa  513  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.02 
 
 		 258 aa  335  5e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.81 
 
 		 256 aa  328  6e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.45 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.26 
 
 		 258 aa  316  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.55 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60 
 
 		 259 aa  304  9.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.21 
 
 		 259 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.59 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.27 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.77 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.77 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.88 
 
 		 266 aa  214  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  48.02 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.61 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.72 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.34 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.77 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.3 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.62 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.98 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.31 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.23 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.27 
 
 		 271 aa  207  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.35 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.89 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.18 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.27 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.91 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.21 
 
 		 273 aa  204  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.73 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.56 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.09 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.94 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.24 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.24 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.34 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.86 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.74 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.76 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.34 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.27 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.85 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.35 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.27 
 
 		 262 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.5 
 
 		 262 aa  201  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.37 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.49 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.15 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.69 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.6 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.06 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.33 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.31 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.53 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.96 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.5 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.74 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.62 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.73 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.1 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.31 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3219  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.99 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365471 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.86 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.5 
 
 		 265 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.35 
 
 		 265 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.71 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.49 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.74 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.55 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.12 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.86 
 
 		 275 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.72 
 
 		 277 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.58 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.23 
 
 		 278 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 		 287 aa  194  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.72 
 
 		 278 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.95 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.03 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.62 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.91 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.87 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.42 
 
 		 294 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.91 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.31 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.22 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.34 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.44 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>