23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0159 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  323  5e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  65.03 
 
 
165 aa  231  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  63.8 
 
 
166 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  38.65 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000419418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  37.2 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  35.58 
 
 
182 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1183  hypothetical protein  40.49 
 
 
166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  33.13 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  32.52 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  34.16 
 
 
201 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  32.3 
 
 
185 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3816  hypothetical protein  31.29 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3866  hypothetical protein  31.29 
 
 
170 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2957  hypothetical protein  29.19 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000744507  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3638  hypothetical protein  30.92 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0190934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0139  hypothetical protein  30.38 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0098  hypothetical protein  28.74 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00649909  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  27.5 
 
 
657 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  26.58 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.168393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2053  hypothetical protein  33.66 
 
 
212 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5215  hypothetical protein  30.7 
 
 
245 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00132012  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  24.39 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2305  putative integral membrane protein  30.39 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>