More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0138 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  72.21 
 
 		 437 aa  653    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  71 
 
 		 438 aa  634    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  100 
 
 		 439 aa  906    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  71.98 
 
 		 438 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  74.26 
 
 		 438 aa  677    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  72.44 
 
 		 438 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  67.81 
 
 		 439 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  48.51 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  47.93 
 
 		 434 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  48.74 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  46.44 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  46.1 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  46.03 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  44.19 
 
 		 435 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  47.76 
 
 		 432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  48.33 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  42.14 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  40.27 
 
 		 447 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  40.22 
 
 		 448 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  42.14 
 
 		 429 aa  338  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  42.4 
 
 		 426 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  44.24 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  41.27 
 
 		 434 aa  335  9e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  43.47 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  41.46 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  41.42 
 
 		 429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  41.47 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  41.51 
 
 		 427 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  41.27 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  42.44 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  40.32 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  39.82 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  40.32 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  39.86 
 
 		 426 aa  319  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  40.32 
 
 		 427 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  40.32 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  40.37 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  40.05 
 
 		 427 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  40.05 
 
 		 427 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  40.05 
 
 		 427 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  40.05 
 
 		 427 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  40.05 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  39.91 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  39.5 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  40 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  40 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  40.05 
 
 		 426 aa  309  8e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  41.28 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  43.78 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  42.34 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  42.34 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  42.34 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  42.09 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  42.09 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  39.53 
 
 		 427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  42.68 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  37.92 
 
 		 468 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  38.46 
 
 		 474 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  42.2 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  42.44 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  42.2 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  42.2 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  42.2 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  42.2 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  42.2 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  42.2 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  42.2 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  40.33 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  37.29 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  38.09 
 
 		 471 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  38.95 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  37.29 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  41.95 
 
 		 428 aa  300  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  37.02 
 
 		 466 aa  299  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  39.1 
 
 		 428 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1096  threonine synthase  39.69 
 
 		 432 aa  293  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  36.97 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  36.85 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  36.13 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  36.67 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  35.33 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  35.9 
 
 		 462 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  41.24 
 
 		 433 aa  289  8e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  35.76 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  37.58 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  35.33 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  35.33 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  36.99 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  34.9 
 
 		 469 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  35.12 
 
 		 469 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  41.4 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  38.99 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  34.9 
 
 		 469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  36.42 
 
 		 461 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  34.48 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  34.48 
 
 		 469 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  36.85 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  36.62 
 
 		 461 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  36.77 
 
 		 465 aa  279  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  36.73 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>