More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0125 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  100 
 
 
218 aa  457  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  59.62 
 
 
213 aa  270  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  58.99 
 
 
226 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  57.55 
 
 
213 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  58.96 
 
 
213 aa  262  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  55.66 
 
 
213 aa  256  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  55.87 
 
 
215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  41.83 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  38.35 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.09 
 
 
211 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.91 
 
 
226 aa  121  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.5 
 
 
346 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.47 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
214 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.67 
 
 
354 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  29.38 
 
 
235 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  36.79 
 
 
228 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.73 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 
218 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 
205 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  33.18 
 
 
218 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  31.53 
 
 
345 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 
218 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 
213 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.64 
 
 
263 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  30.46 
 
 
235 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
471 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  30.1 
 
 
346 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
208 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 
195 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  33.65 
 
 
237 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 
210 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  34.38 
 
 
229 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.52 
 
 
214 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.41 
 
 
233 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  32.13 
 
 
466 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
464 aa  101  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  29.36 
 
 
258 aa  101  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  33.68 
 
 
229 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 
249 aa  101  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
209 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 
382 aa  100  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
205 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
469 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 
459 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 
459 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
229 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
229 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  30.73 
 
 
232 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 
459 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
464 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  33.64 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  30.1 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  30.1 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  28.29 
 
 
346 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 
470 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 
467 aa  98.6  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 
459 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  32.18 
 
 
248 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.65 
 
 
459 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 
459 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  31.4 
 
 
250 aa  98.6  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  31 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  36 
 
 
344 aa  98.2  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.18 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  30.29 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  29.85 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.21 
 
 
361 aa  97.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
444 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.22 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 
376 aa  97.1  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.67 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  31.28 
 
 
455 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  27.04 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  29.17 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
480 aa  96.3  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.81 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
466 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
470 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 
469 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  29.61 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 
471 aa  95.5  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.91 
 
 
263 aa  95.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>