135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0101 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  75.06 
 
 
434 aa  707    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  905    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  54.61 
 
 
430 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  48.62 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  48.39 
 
 
435 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  45.71 
 
 
430 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  45.18 
 
 
432 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  44.34 
 
 
433 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  43.95 
 
 
439 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  45.63 
 
 
429 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  46.06 
 
 
392 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  40.32 
 
 
433 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  39.57 
 
 
426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  29.13 
 
 
419 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  29.3 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  27.49 
 
 
419 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  27.49 
 
 
419 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  28.02 
 
 
431 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  31.84 
 
 
391 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  29.52 
 
 
380 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.88 
 
 
444 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  27.97 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  29.92 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  29.13 
 
 
449 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 
419 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  27.64 
 
 
429 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.68 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
411 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  26.45 
 
 
411 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  27.25 
 
 
407 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  26.72 
 
 
412 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  29.03 
 
 
295 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 
430 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  22.01 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  27.88 
 
 
430 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  28.52 
 
 
431 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  25.25 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  25.35 
 
 
415 aa  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  27.8 
 
 
430 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  24.75 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  23.44 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  28.44 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  24.33 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  26.8 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  25.33 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  26.8 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  24.64 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  27.58 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  24.34 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  28.41 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  22.88 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  26.19 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  24.02 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  21.62 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  24.02 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  26.36 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  24.72 
 
 
440 aa  77  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  27 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  24.31 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  26.28 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  24.64 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  26.81 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  21.82 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  25.18 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  24.86 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  32.08 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  32.47 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  35.14 
 
 
120 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  25.14 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  26.52 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  21.41 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  23.25 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  25.57 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  23.97 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  25.96 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  28.18 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  27.97 
 
 
305 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  26.18 
 
 
318 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  23.98 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  26.12 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  24.72 
 
 
429 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  25.45 
 
 
318 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  28.17 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  26.94 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  24.05 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.62 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  20.47 
 
 
312 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  27.94 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  25.63 
 
 
408 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  28.29 
 
 
418 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  21.21 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  24.72 
 
 
317 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  28.48 
 
 
318 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  25.23 
 
 
443 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  28.14 
 
 
402 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  27.07 
 
 
251 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  24.18 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  27.93 
 
 
435 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  25 
 
 
152 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  28.05 
 
 
439 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.875392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>