More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0071 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  100 
 
 
234 aa  485  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  67.86 
 
 
233 aa  322  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.17 
 
 
233 aa  295  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  61.88 
 
 
233 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.75 
 
 
232 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  56.19 
 
 
232 aa  268  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.61 
 
 
254 aa  261  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.57 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.61 
 
 
225 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  36.94 
 
 
236 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.94 
 
 
229 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.55 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.6 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.46 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  36.54 
 
 
232 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  32.04 
 
 
214 aa  121  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.67 
 
 
456 aa  119  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.68 
 
 
456 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.18 
 
 
456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  34.76 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.78 
 
 
219 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.21 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  35.83 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  36.67 
 
 
202 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  36.67 
 
 
202 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  36.22 
 
 
202 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.86 
 
 
215 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.76 
 
 
201 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.56 
 
 
219 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
215 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  31.91 
 
 
222 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
220 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.08 
 
 
217 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  30.05 
 
 
219 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.14 
 
 
200 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  31.94 
 
 
227 aa  101  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  34.03 
 
 
200 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  23.56 
 
 
221 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  34.45 
 
 
221 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.57 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  34.92 
 
 
188 aa  98.6  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.52 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
226 aa  98.6  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.46 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  29.47 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  27.31 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  34.34 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  32.83 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.47 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  30.18 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  33.85 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.46 
 
 
217 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  37.16 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  29.05 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.24 
 
 
201 aa  95.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  31.44 
 
 
218 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.62 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  32.65 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  32.65 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  32.65 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  30.69 
 
 
221 aa  94  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  32.06 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  29.18 
 
 
237 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.59 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  32.46 
 
 
188 aa  92.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  32.6 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.98 
 
 
221 aa  92.8  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  29.9 
 
 
207 aa  92.4  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.5 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.96 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  33.68 
 
 
188 aa  91.7  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  30.93 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  32.14 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  29.1 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.29 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  31.72 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
188 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
188 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.85 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
188 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  32.14 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  34.02 
 
 
221 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  25.11 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  27.72 
 
 
221 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2478  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642975  normal  0.83029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.38 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  29.26 
 
 
219 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.85 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.69 
 
 
221 aa  89  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  32.65 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.81 
 
 
218 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.81 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.32 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  30.93 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>