More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0045 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 336 aa  691    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  56.25 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  61.42 
 
 		 337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  61.54 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  59.63 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  51.98 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  50.85 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  44.33 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 345 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  37.92 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  36.71 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  35.6 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  38.65 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  35.58 
 
 		 333 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  34.69 
 
 		 356 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  37.31 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  37.98 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  41.1 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  39.35 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  35.06 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  33.05 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  34.62 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  39.56 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  30.33 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  31.42 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  39.69 
 
 		 414 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  33.98 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  32.04 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  34.35 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  31.98 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  36.29 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 		 620 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  34.54 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  34.33 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  38.52 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  34.59 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  30.49 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  38.43 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  35.53 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  36.24 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  32.91 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  35.46 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  38.37 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  31.12 
 
 		 337 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  34.21 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  37.31 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  33.63 
 
 		 405 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  34.05 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  31.5 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  36.64 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  35.43 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  32.01 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  36.08 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  31.13 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  35.67 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  33.76 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  40.44 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  35.79 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  35.67 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  32.89 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  38.67 
 
 		 391 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  34.15 
 
 		 599 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  29.43 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  36.5 
 
 		 331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  32.78 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  31.4 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  34.77 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 353 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  35.99 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  34.33 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  36.5 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  31.94 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  27.66 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  33.77 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  27.36 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  37.35 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  34.75 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  32.89 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  37.45 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  31.87 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  35.09 
 
 		 363 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  37.45 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>