More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0040 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  100 
 
 		 342 aa  692    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  63.11 
 
 		 346 aa  362  4e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  60.33 
 
 		 331 aa  344  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  59.02 
 
 		 328 aa  335  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  53.27 
 
 		 332 aa  316  4e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  40.6 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  40.5 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  43.4 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  43.15 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  39.22 
 
 		 359 aa  238  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  38.58 
 
 		 368 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  40.38 
 
 		 368 aa  225  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  39.26 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  38.42 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  40.8 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  38.57 
 
 		 366 aa  215  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  39.16 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  37.27 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  37.94 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  36.06 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  38.25 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  40.34 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  43.71 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  34.05 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  43.05 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  37.58 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 395 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  37.27 
 
 		 352 aa  192  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.46 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  37.99 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.99 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1574  secretion protein HlyD  43.88 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  34.85 
 
 		 380 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  37.77 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.23 
 
 		 351 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  36.25 
 
 		 390 aa  186  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  36.49 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  35.65 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.09 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6361  secretion protein HlyD family protein  42.12 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  35.22 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1467  secretion protein HlyD  42.12 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0027674  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7028  secretion protein HlyD family protein  42.12 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146297  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0561  secretion protein HlyD family protein  38.41 
 
 		 348 aa  179  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  33.02 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  36.2 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  35.31 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  37.23 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  34.77 
 
 		 393 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 		 443 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.2 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  34.43 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  32.66 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  33.14 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.5 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  32.7 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  33.99 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  36.84 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  35.9 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  33.23 
 
 		 351 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  38.6 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  31.74 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  35.98 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.25 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  32.3 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  34.92 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  34.59 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  32.64 
 
 		 470 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  33.51 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  32.64 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  32.64 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  34.38 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  32.6 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  33.14 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  36.91 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  33.83 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  33.86 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  33.93 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  33.64 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1293  multidrug resistance A (translocase) transmembrane protein  32.84 
 
 		 428 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  36.68 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>