67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0022 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  100 
 
 		 309 aa  633    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  45.7 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  44.01 
 
 		 302 aa  265  5e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  38.01 
 
 		 686 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  29.9 
 
 		 315 aa  158  9e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  32.63 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  32.08 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  32.1 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  29.69 
 
 		 334 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  32.93 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  27.36 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  31.55 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  30.67 
 
 		 554 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  29.97 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  31.61 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  34.44 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1002 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  34.02 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  31.2 
 
 		 332 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  31.2 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  31.2 
 
 		 332 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  31.2 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  31.2 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  31.2 
 
 		 375 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  31.2 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  28.21 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  33.14 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  31.18 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  35.34 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  35.34 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  30.28 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  33.91 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  27.08 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  28.7 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  27.71 
 
 		 374 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  31.25 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  29.55 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  26.81 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  28.74 
 
 		 371 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  28.74 
 
 		 371 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  28.74 
 
 		 371 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  29.17 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  29.33 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  30.63 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  31.98 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  28.04 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  30.43 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  29.72 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  24.57 
 
 		 714 aa  76.3  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  27.61 
 
 		 1678 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  28.46 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  27.78 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  27.7 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  24.46 
 
 		 2272 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  26.75 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  27.9 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  26.2 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  26.69 
 
 		 1113 aa  52.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  29.38 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  30.58 
 
 		 615 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0218  patatin  28.79 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0216  patatin  28.79 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  27.96 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  23.96 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  27.96 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  24.82 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>