65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0021 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  820    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  59.6 
 
 		 420 aa  498  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  58.99 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  52.38 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  50.88 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  48.51 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  48.99 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  32.52 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  30.92 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  31.27 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  29.55 
 
 		 394 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  28.21 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  27.64 
 
 		 396 aa  170  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  32.05 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  26.75 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  27.94 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  29.97 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  27.34 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  26.79 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  25.67 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  26.11 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  25.07 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  27.07 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  26.36 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  26.29 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  26.88 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  24.29 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  27.84 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  25.49 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  27.41 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  24.42 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  24.87 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  23.21 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  23.26 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  23.21 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  23.21 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  24.48 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  25.28 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  25 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  23.01 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  25.85 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  25.67 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  24.8 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  25.5 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  25.1 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  22.29 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  24.27 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  22.39 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  23.1 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  26.18 
 
 		 443 aa  57  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  23.65 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  21.99 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  30.69 
 
 		 252 aa  49.3  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  33.71 
 
 		 214 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3894  (Uracil-5)-methyltransferase  24.54 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  23.47 
 
 		 487 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  22.43 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.25 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  32.93 
 
 		 189 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  22.97 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  32.48 
 
 		 216 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  32.38 
 
 		 204 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  28.81 
 
 		 205 aa  43.1  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1834  (Uracil-5)-methyltransferase  29.03 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>