39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0016 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0016  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  255  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1240  hypothetical protein  46.77 
 
 
130 aa  120  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0899375  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3202  hypothetical protein  44.54 
 
 
127 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.317376  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0930  protein of unknown function DUF86  42.86 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.922217  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1208  protein of unknown function DUF86  47.46 
 
 
126 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1519  protein of unknown function DUF86  41.57 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.2684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  38.39 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  38.39 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  28.21 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  31.58 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  35 
 
 
114 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  36.36 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1765  protein of unknown function DUF86  29.66 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1935  protein of unknown function DUF86  28.93 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1729  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.993735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3483  protein of unknown function DUF86  31.13 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  28.18 
 
 
115 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  29.35 
 
 
114 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3118  hypothetical protein  27.27 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0549  hypothetical protein  32.88 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0885  hypothetical protein  30.85 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152206  hitchhiker  0.00000000727244 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  32.89 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0370  hypothetical protein  29.58 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.823692  normal  0.271446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  29.85 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3744  protein of unknown function DUF86  28 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2968  protein of unknown function DUF86  27.16 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1854  protein of unknown function DUF86  32.39 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0899  hypothetical protein  32.65 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84236  unclonable  0.000014673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1880  protein of unknown function DUF86  32.39 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3141  protein of unknown function DUF86  27.16 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1229  hypothetical protein  30 
 
 
117 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.949454  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0358  hypothetical protein  29.07 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1369  hypothetical protein  28.95 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.150444  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3038  protein of unknown function DUF86  29.87 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3298  protein of unknown function DUF86  28.95 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  28.41 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  25.32 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0089  hypothetical protein  30.3 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  30.61 
 
 
123 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.234797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>